Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms