RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.14■■■■■ 4.34
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SEH1L-202ENST00000399892 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.22■■■■□ 3.23
SEH1L-202ENST00000399892 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SEH1L-202ENST00000399892 NACADO15069 1562 aa35■■■■□ 3.19
SEH1L-202ENST00000399892 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.98■■■■□ 3.19
SEH1L-202ENST00000399892 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
SEH1L-202ENST00000399892 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.86■■■■□ 3.17
SEH1L-202ENST00000399892 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.2■■■■□ 3.07
SEH1L-202ENST00000399892 SCRIBQ14160 1630 aa34.14■■■■□ 3.06
SEH1L-202ENST00000399892 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
SEH1L-202ENST00000399892 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.83■■■■□ 3.01
SEH1L-202ENST00000399892 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.62■■■□□ 2.97
SEH1L-202ENST00000399892 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
SEH1L-202ENST00000399892 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.81■■■□□ 2.84
SEH1L-202ENST00000399892 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.79■■■□□ 2.84
SEH1L-202ENST00000399892 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.75■■■□□ 2.83
SEH1L-202ENST00000399892 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
SEH1L-202ENST00000399892 SMARCA4P51532 1647 aa32.65■■■□□ 2.82
SEH1L-202ENST00000399892 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.49■■■□□ 2.79
SEH1L-202ENST00000399892 SMARCA2P51531 1590 aa32.37■■■□□ 2.77
SEH1L-202ENST00000399892 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.35■■■□□ 2.77
SEH1L-202ENST00000399892 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.27■■■□□ 2.76
SEH1L-202ENST00000399892 NCAPD3P42695 1498 aa32.25■■■□□ 2.75
SEH1L-202ENST00000399892 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
SEH1L-202ENST00000399892 WIZO95785 1651 aa32.2■■■□□ 2.75
SEH1L-202ENST00000399892 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
SEH1L-202ENST00000399892 HMGXB3Q12766 1538 aa32.15■■■□□ 2.74
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SEH1L-202ENST00000399892 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.48■■■□□ 2.63
SEH1L-202ENST00000399892 NESP48681 1621 aa31.41■■■□□ 2.62
SEH1L-202ENST00000399892 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.4■■■□□ 2.62
SEH1L-202ENST00000399892 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.37■■■□□ 2.61
SEH1L-202ENST00000399892 CFTRP13569 1480 aa31.25■■■□□ 2.59
SEH1L-202ENST00000399892 ERCC6Q03468 1493 aa31.23■■■□□ 2.59
SEH1L-202ENST00000399892 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.2■■■□□ 2.58
SEH1L-202ENST00000399892 PRDM2Q13029 1718 aa31.12■■■□□ 2.57
SEH1L-202ENST00000399892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.09■■■□□ 2.57
SEH1L-202ENST00000399892 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.03■■■□□ 2.56
SEH1L-202ENST00000399892 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.98■■■□□ 2.55
SEH1L-202ENST00000399892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
SEH1L-202ENST00000399892 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.83■■■□□ 2.53
SEH1L-202ENST00000399892 WDR62O43379 1518 aa30.69■■■□□ 2.5
SEH1L-202ENST00000399892 CUX2O14529 1486 aa30.68■■■□□ 2.5
SEH1L-202ENST00000399892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SEH1L-202ENST00000399892 ABCC8Q09428 1581 aa30.61■■■□□ 2.49
SEH1L-202ENST00000399892 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.57■■■□□ 2.48
SEH1L-202ENST00000399892 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.48
SEH1L-202ENST00000399892 CUX1P39880 1505 aa30.46■■■□□ 2.47
SEH1L-202ENST00000399892 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
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SEH1L-202ENST00000399892 SYNJ1O43426 1573 aa30.33■■■□□ 2.45
SEH1L-202ENST00000399892 TOP2BQ02880 1626 aa30.32■■■□□ 2.44
SEH1L-202ENST00000399892 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.32■■■□□ 2.44
SEH1L-202ENST00000399892 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.31■■■□□ 2.44
SEH1L-202ENST00000399892 IFT140Q96RY7 1462 aa30.29■■■□□ 2.44
SEH1L-202ENST00000399892 SOGA1O94964 1423 aa30.24■■■□□ 2.43
SEH1L-202ENST00000399892 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.2■■■□□ 2.43
SEH1L-202ENST00000399892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SEH1L-202ENST00000399892 TRIM41Q8WV44 630 aa30.05■■■□□ 2.4
SEH1L-202ENST00000399892 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SEH1L-202ENST00000399892 WDR97A6NE52 1622 aa30.03■■■□□ 2.4
SEH1L-202ENST00000399892 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.03■■■□□ 2.4
SEH1L-202ENST00000399892 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
SEH1L-202ENST00000399892 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
SEH1L-202ENST00000399892 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.9■■■□□ 2.38
SEH1L-202ENST00000399892 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.88■■■□□ 2.37
SEH1L-202ENST00000399892 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.86■■■□□ 2.37
SEH1L-202ENST00000399892 PBRM1Q86U86 1689 aa29.83■■■□□ 2.37
SEH1L-202ENST00000399892 GRIN2BQ13224 1484 aa29.83■■■□□ 2.37
SEH1L-202ENST00000399892 KIF27Q86VH2 1401 aa29.79■■■□□ 2.36
SEH1L-202ENST00000399892 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.74■■■□□ 2.35
SEH1L-202ENST00000399892 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SEH1L-202ENST00000399892 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.7■■■□□ 2.34
SEH1L-202ENST00000399892 FBLN2P98095 1184 aa29.68■■■□□ 2.34
SEH1L-202ENST00000399892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SEH1L-202ENST00000399892 CHD1O14646 1710 aa29.61■■■□□ 2.33
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SEH1L-202ENST00000399892 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.59■■■□□ 2.33
SEH1L-202ENST00000399892 ADAMTS12P58397 1594 aa29.58■■■□□ 2.33
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SEH1L-202ENST00000399892 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.55■■■□□ 2.32
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SEH1L-202ENST00000399892 OSCARQ8IYS5 282 aa29.52■■■□□ 2.32
SEH1L-202ENST00000399892 EEA1Q15075 1411 aa29.47■■■□□ 2.31
SEH1L-202ENST00000399892 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.45■■■□□ 2.3
SEH1L-202ENST00000399892 GRIN2AQ12879 1464 aa29.45■■■□□ 2.3
SEH1L-202ENST00000399892 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SEH1L-202ENST00000399892 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.38■■■□□ 2.29
SEH1L-202ENST00000399892 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.32■■■□□ 2.28
SEH1L-202ENST00000399892 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.29■■■□□ 2.28
SEH1L-202ENST00000399892 CEP170Q5SW79 1584 aa29.27■■■□□ 2.28
SEH1L-202ENST00000399892 NUP160Q12769 1436 aa29.25■■■□□ 2.27
SEH1L-202ENST00000399892 PRXQ9BXM0 1461 aa29.25■■■□□ 2.27
SEH1L-202ENST00000399892 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.22■■■□□ 2.27
SEH1L-202ENST00000399892 KIF21BO75037 1637 aa29.12■■■□□ 2.25
SEH1L-202ENST00000399892 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.11■■■□□ 2.25
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