RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233121.6

MAPRE3-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE3, Length 1,892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3-201ENST00000233121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.65■■■■□ 3.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.25■■■■□ 3.07
MAPRE3-201ENST00000233121 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
MAPRE3-201ENST00000233121 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
MAPRE3-201ENST00000233121 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.77■■■□□ 2.84
MAPRE3-201ENST00000233121 ABCC9O60706 1549 aa32.63■■■□□ 2.81
MAPRE3-201ENST00000233121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.59■■■□□ 2.81
MAPRE3-201ENST00000233121 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.1■■■□□ 2.73
MAPRE3-201ENST00000233121 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
MAPRE3-201ENST00000233121 NACADO15069 1562 aa31.72■■■□□ 2.67
MAPRE3-201ENST00000233121 SCRIBQ14160 1630 aa31.64■■■□□ 2.66
MAPRE3-201ENST00000233121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
MAPRE3-201ENST00000233121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
MAPRE3-201ENST00000233121 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.01■■■□□ 2.56
MAPRE3-201ENST00000233121 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.97■■■□□ 2.55
MAPRE3-201ENST00000233121 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.77■■■□□ 2.52
MAPRE3-201ENST00000233121 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.68■■■□□ 2.5
MAPRE3-201ENST00000233121 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
MAPRE3-201ENST00000233121 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.63■■■□□ 2.49
MAPRE3-201ENST00000233121 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
MAPRE3-201ENST00000233121 WIZO95785 1651 aa30.49■■■□□ 2.47
MAPRE3-201ENST00000233121 SMARCA4P51532 1647 aa30.36■■■□□ 2.45
MAPRE3-201ENST00000233121 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
MAPRE3-201ENST00000233121 TRIM41Q8WV44 630 aa30.06■■■□□ 2.4
MAPRE3-201ENST00000233121 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
MAPRE3-201ENST00000233121 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.92■■■□□ 2.38
MAPRE3-201ENST00000233121 SMARCA2P51531 1590 aa29.92■■■□□ 2.38
MAPRE3-201ENST00000233121 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.87■■■□□ 2.37
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.87■■■□□ 2.37
MAPRE3-201ENST00000233121 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.65■■■□□ 2.34
MAPRE3-201ENST00000233121 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
MAPRE3-201ENST00000233121 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
MAPRE3-201ENST00000233121 ABCC8Q09428 1581 aa29.51■■■□□ 2.31
MAPRE3-201ENST00000233121 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.49■■■□□ 2.31
MAPRE3-201ENST00000233121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.48■■■□□ 2.31
MAPRE3-201ENST00000233121 HMGXB3Q12766 1538 aa29.3■■■□□ 2.28
MAPRE3-201ENST00000233121 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.3■■■□□ 2.28
MAPRE3-201ENST00000233121 NCAPD3P42695 1498 aa29.26■■■□□ 2.27
MAPRE3-201ENST00000233121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
MAPRE3-201ENST00000233121 EEA1Q15075 1411 aa29.18■■■□□ 2.26
MAPRE3-201ENST00000233121 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.12■■■□□ 2.25
MAPRE3-201ENST00000233121 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
MAPRE3-201ENST00000233121 SOGA1O94964 1423 aa29.08■■■□□ 2.25
MAPRE3-201ENST00000233121 SYNJ1O43426 1573 aa29.08■■■□□ 2.25
MAPRE3-201ENST00000233121 HRCP23327 699 aa29.04■■■□□ 2.24
MAPRE3-201ENST00000233121 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.95■■■□□ 2.23
MAPRE3-201ENST00000233121 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
MAPRE3-201ENST00000233121 TOP2BQ02880 1626 aa28.9■■■□□ 2.22
MAPRE3-201ENST00000233121 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
MAPRE3-201ENST00000233121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.86■■■□□ 2.21
MAPRE3-201ENST00000233121 GOLGA3Q08378 1498 aa28.83■■■□□ 2.21
MAPRE3-201ENST00000233121 CFTRP13569 1480 aa28.83■■■□□ 2.21
MAPRE3-201ENST00000233121 PRDM2Q13029 1718 aa28.79■■■□□ 2.2
MAPRE3-201ENST00000233121 KIF21BO75037 1637 aa28.77■■■□□ 2.2
MAPRE3-201ENST00000233121 CEP162Q5TB80 1403 aa28.77■■■□□ 2.2
MAPRE3-201ENST00000233121 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.75■■■□□ 2.19
MAPRE3-201ENST00000233121 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
MAPRE3-201ENST00000233121 CUX1P39880 1505 aa28.64■■■□□ 2.18
MAPRE3-201ENST00000233121 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.58■■■□□ 2.17
MAPRE3-201ENST00000233121 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.47■■■□□ 2.15
MAPRE3-201ENST00000233121 NESP48681 1621 aa28.46■■■□□ 2.15
MAPRE3-201ENST00000233121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.44■■■□□ 2.14
MAPRE3-201ENST00000233121 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
MAPRE3-201ENST00000233121 KIF27Q86VH2 1401 aa28.43■■■□□ 2.14
MAPRE3-201ENST00000233121 PRXQ9BXM0 1461 aa28.39■■■□□ 2.14
MAPRE3-201ENST00000233121 CLIP1P30622 1438 aa28.39■■■□□ 2.14
MAPRE3-201ENST00000233121 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
MAPRE3-201ENST00000233121 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.28■■■□□ 2.12
MAPRE3-201ENST00000233121 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.27■■■□□ 2.12
MAPRE3-201ENST00000233121 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.24■■■□□ 2.11
MAPRE3-201ENST00000233121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.23■■■□□ 2.11
MAPRE3-201ENST00000233121 CUX2O14529 1486 aa28.19■■■□□ 2.1
MAPRE3-201ENST00000233121 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.17■■■□□ 2.1
MAPRE3-201ENST00000233121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.11■■■□□ 2.09
MAPRE3-201ENST00000233121 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
MAPRE3-201ENST00000233121 IGF1RP08069 1367 aa28.07■■■□□ 2.08
MAPRE3-201ENST00000233121 TOPBP1Q92547 1522 aa28.06■■■□□ 2.08
MAPRE3-201ENST00000233121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.04■■■□□ 2.08
MAPRE3-201ENST00000233121 APLP2Q06481 763 aa28.03■■■□□ 2.08
MAPRE3-201ENST00000233121 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 ARAP1Q96P48 1450 aa28■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.98■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 ERCC6Q03468 1493 aa27.98■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.96■■■□□ 2.07
MAPRE3-201ENST00000233121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.9■■■□□ 2.06
MAPRE3-201ENST00000233121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.87■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 WDR97A6NE52 1622 aa27.84■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 CUL7Q14999 1698 aa27.83■■■□□ 2.05
MAPRE3-201ENST00000233121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
MAPRE3-201ENST00000233121 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.77■■■□□ 2.04
MAPRE3-201ENST00000233121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.7■■■□□ 2.03
MAPRE3-201ENST00000233121 WDR62O43379 1518 aa27.66■■■□□ 2.02
MAPRE3-201ENST00000233121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.65■■■□□ 2.02
MAPRE3-201ENST00000233121 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.61■■■□□ 2.01
MAPRE3-201ENST00000233121 MAP3K1Q13233 1512 aa27.61■■■□□ 2.01
MAPRE3-201ENST00000233121 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.59■■■□□ 2.01
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