RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
PLGRKT-201ENST00000223864 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.7■■■■■ 4.91
PLGRKT-201ENST00000223864 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.31■■■■■ 4.36
PLGRKT-201ENST00000223864 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PLGRKT-201ENST00000223864 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.82■■■■□ 3.64
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC9O60706 1549 aa37.21■■■■□ 3.55
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXD1Q16676 465 aa37.11■■■■□ 3.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.89■■■■□ 3.5
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.73■■■■□ 3.31
PLGRKT-201ENST00000223864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.71■■■■□ 3.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ADRA2BP18089 450 aa35.6■■■■□ 3.29
PLGRKT-201ENST00000223864 NACADO15069 1562 aa35.59■■■■□ 3.29
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.44■■■■□ 3.26
PLGRKT-201ENST00000223864 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.28■■■■□ 3.24
PLGRKT-201ENST00000223864 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.01■■■■□ 3.2
PLGRKT-201ENST00000223864 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.99■■■■□ 3.19
PLGRKT-201ENST00000223864 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PLGRKT-201ENST00000223864 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
PLGRKT-201ENST00000223864 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.64■■■■□ 3.14
PLGRKT-201ENST00000223864 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.43■■■■□ 3.1
PLGRKT-201ENST00000223864 SCRIBQ14160 1630 aa34.42■■■■□ 3.1
PLGRKT-201ENST00000223864 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.24■■■■□ 3.07
PLGRKT-201ENST00000223864 MSH5O43196 834 aa33.99■■■■□ 3.03
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PLGRKT-201ENST00000223864 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.69■■■□□ 2.98
PLGRKT-201ENST00000223864 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.48■■■□□ 2.95
PLGRKT-201ENST00000223864 SMARCA4P51532 1647 aa32.92■■■□□ 2.86
PLGRKT-201ENST00000223864 NCAPD3P42695 1498 aa32.83■■■□□ 2.85
PLGRKT-201ENST00000223864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.79■■■□□ 2.84
PLGRKT-201ENST00000223864 SMARCA2P51531 1590 aa32.75■■■□□ 2.83
PLGRKT-201ENST00000223864 HMGXB3Q12766 1538 aa32.65■■■□□ 2.82
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa32.61■■■□□ 2.81
PLGRKT-201ENST00000223864 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.61■■■□□ 2.81
PLGRKT-201ENST00000223864 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.6■■■□□ 2.81
PLGRKT-201ENST00000223864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
PLGRKT-201ENST00000223864 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
PLGRKT-201ENST00000223864 WIZO95785 1651 aa32.27■■■□□ 2.76
PLGRKT-201ENST00000223864 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
PLGRKT-201ENST00000223864 NESP48681 1621 aa32.11■■■□□ 2.73
PLGRKT-201ENST00000223864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
PLGRKT-201ENST00000223864 ERCC6Q03468 1493 aa32.1■■■□□ 2.73
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.04■■■□□ 2.72
PLGRKT-201ENST00000223864 CUX2O14529 1486 aa31.89■■■□□ 2.7
PLGRKT-201ENST00000223864 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
PLGRKT-201ENST00000223864 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.83■■■□□ 2.69
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNA4P22459 653 aa31.81■■■□□ 2.68
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.8■■■□□ 2.68
PLGRKT-201ENST00000223864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.79■■■□□ 2.68
PLGRKT-201ENST00000223864 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.76■■■□□ 2.67
PLGRKT-201ENST00000223864 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PLGRKT-201ENST00000223864 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa31.63■■■□□ 2.65
PLGRKT-201ENST00000223864 CFTRP13569 1480 aa31.59■■■□□ 2.65
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.49■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.49■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 POTEDQ86YR6 584 aa31.49■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.47■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.47■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 PRDM2Q13029 1718 aa31.45■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR62O43379 1518 aa31.41■■■□□ 2.62
PLGRKT-201ENST00000223864 NPM3O75607 178 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
PLGRKT-201ENST00000223864 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.27■■■□□ 2.6
PLGRKT-201ENST00000223864 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PLGRKT-201ENST00000223864 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC8Q09428 1581 aa30.96■■■□□ 2.55
PLGRKT-201ENST00000223864 TOPBP1Q92547 1522 aa30.95■■■□□ 2.55
PLGRKT-201ENST00000223864 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.9■■■□□ 2.54
PLGRKT-201ENST00000223864 IFT140Q96RY7 1462 aa30.82■■■□□ 2.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PLGRKT-201ENST00000223864 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PLGRKT-201ENST00000223864 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PLGRKT-201ENST00000223864 CUX1P39880 1505 aa30.6■■■□□ 2.49
PLGRKT-201ENST00000223864 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.54■■■□□ 2.48
PLGRKT-201ENST00000223864 SOGA1O94964 1423 aa30.53■■■□□ 2.48
PLGRKT-201ENST00000223864 OSCARQ8IYS5 282 aa30.52■■■□□ 2.48
PLGRKT-201ENST00000223864 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.51■■■□□ 2.48
PLGRKT-201ENST00000223864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR97A6NE52 1622 aa30.41■■■□□ 2.46
PLGRKT-201ENST00000223864 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.34■■■□□ 2.45
PLGRKT-201ENST00000223864 CHD1O14646 1710 aa30.33■■■□□ 2.45
PLGRKT-201ENST00000223864 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.3■■■□□ 2.44
PLGRKT-201ENST00000223864 TOP2BQ02880 1626 aa30.28■■■□□ 2.44
PLGRKT-201ENST00000223864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNJ1O43426 1573 aa30.24■■■□□ 2.43
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.23■■■□□ 2.43
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIN2BQ13224 1484 aa30.21■■■□□ 2.43
PLGRKT-201ENST00000223864 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.19■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 PBRM1Q86U86 1689 aa30.19■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.18■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 FBLN2P98095 1184 aa30.17■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.17■■■□□ 2.42
PLGRKT-201ENST00000223864 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms