Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNTG1Q9NSN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTG1Q9NSN8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms