Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNTG1Q9NSN8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNTG1Q9NSN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNTG1Q9NSN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNTG1Q9NSN8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNTG1Q9NSN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNTG1Q9NSN8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNTG1Q9NSN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SNTG1Q9NSN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNTG1Q9NSN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNTG1Q9NSN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNTG1Q9NSN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNTG1Q9NSN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SNTG1Q9NSN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNTG1Q9NSN8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNTG1Q9NSN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNTG1Q9NSN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNTG1Q9NSN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNTG1Q9NSN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNTG1Q9NSN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNTG1Q9NSN8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNTG1Q9NSN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNTG1Q9NSN8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNTG1Q9NSN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTG1Q9NSN8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNTG1Q9NSN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNTG1Q9NSN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNTG1Q9NSN8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNTG1Q9NSN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNTG1Q9NSN8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG1Q9NSN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG1Q9NSN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNTG1Q9NSN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNTG1Q9NSN8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNTG1Q9NSN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNTG1Q9NSN8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNTG1Q9NSN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNTG1Q9NSN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNTG1Q9NSN8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNTG1Q9NSN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNTG1Q9NSN8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNTG1Q9NSN8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNTG1Q9NSN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNTG1Q9NSN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNTG1Q9NSN8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNTG1Q9NSN8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNTG1Q9NSN8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNTG1Q9NSN8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNTG1Q9NSN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNTG1Q9NSN8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNTG1Q9NSN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNTG1Q9NSN8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNTG1Q9NSN8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNTG1Q9NSN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNTG1Q9NSN8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNTG1Q9NSN8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNTG1Q9NSN8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNTG1Q9NSN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNTG1Q9NSN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNTG1Q9NSN8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNTG1Q9NSN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNTG1Q9NSN8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNTG1Q9NSN8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNTG1Q9NSN8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNTG1Q9NSN8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNTG1Q9NSN8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNTG1Q9NSN8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNTG1Q9NSN8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNTG1Q9NSN8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNTG1Q9NSN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNTG1Q9NSN8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG1Q9NSN8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG1Q9NSN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNTG1Q9NSN8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG1Q9NSN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG1Q9NSN8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms