Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GKAP1Q5VSY0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GKAP1Q5VSY0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GKAP1Q5VSY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GKAP1Q5VSY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms