Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX8P57073 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX8P57073 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX8P57073 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX8P57073 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX8P57073 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX8P57073 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX8P57073 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX8P57073 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX8P57073 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX8P57073 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX8P57073 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX8P57073 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX8P57073 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX8P57073 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX8P57073 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX8P57073 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX8P57073 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX8P57073 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX8P57073 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX8P57073 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX8P57073 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX8P57073 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX8P57073 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX8P57073 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX8P57073 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX8P57073 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX8P57073 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX8P57073 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX8P57073 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX8P57073 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX8P57073 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX8P57073 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX8P57073 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX8P57073 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX8P57073 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX8P57073 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX8P57073 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX8P57073 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX8P57073 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX8P57073 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX8P57073 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX8P57073 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX8P57073 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX8P57073 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX8P57073 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX8P57073 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms