Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD38P28907 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD38P28907 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD38P28907 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD38P28907 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD38P28907 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD38P28907 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD38P28907 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD38P28907 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD38P28907 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD38P28907 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD38P28907 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD38P28907 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD38P28907 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD38P28907 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD38P28907 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD38P28907 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD38P28907 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD38P28907 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CD38P28907 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD38P28907 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD38P28907 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD38P28907 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD38P28907 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD38P28907 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD38P28907 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD38P28907 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD38P28907 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD38P28907 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD38P28907 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD38P28907 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD38P28907 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD38P28907 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD38P28907 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD38P28907 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD38P28907 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD38P28907 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD38P28907 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD38P28907 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD38P28907 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD38P28907 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD38P28907 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD38P28907 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD38P28907 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD38P28907 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD38P28907 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD38P28907 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD38P28907 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD38P28907 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD38P28907 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD38P28907 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD38P28907 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD38P28907 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD38P28907 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms