Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CDH2-205ENST00000430882 610 ntTSL 45.26□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 25.23□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.633e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-204ENST00000625463 340 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AL031674.1-206ENST00000422666 374 ntTSL 34.26□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 44.21□□□□□ -1.743e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AL031674.1-204ENST00000425279 321 ntTSL 34.13□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AL031674.1-205ENST00000437987 182 ntTSL 34.03□□□□□ -1.763e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AGPAT5-207ENST00000533648 560 ntTSL 43.45□□□□□ -1.863e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.243e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.353e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.23e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.513e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.23e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC39A11-206ENST00000579491 692 ntTSL 311.66□□□□□ -0.542e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC39A11-217ENST00000584129 747 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-9■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 36.25□□□□□ -1.418e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.641e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.02□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB6-201ENST00000520790 4599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.595e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGB4-201ENST00000519479 4578 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA4-201ENST00000571252 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGC4-201ENST00000306593 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.745e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGA2-201ENST00000394576 4605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PCDHGC5-201ENST00000252087 4761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.399e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.139e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 09e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 27.35□□□□□ -1.239e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-218ENST00000606570 3931 nt6.41□□□□□ -1.389e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-209ENST00000476648 950 ntTSL 35.02□□□□□ -1.619e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SNX5-215ENST00000491090 819 ntTSL 34.66□□□□□ -1.669e-88■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-214ENST00000476932 2269 ntTSL 220.78■□□□□ 0.924e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-215ENST00000484252 2099 ntTSL 219.45■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.694e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-212ENST00000466410 2592 ntTSL 219.08■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-211ENST00000426981 1409 ntTSL 317.15■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-216ENST00000494613 1137 ntTSL 214.58□□□□□ -0.084e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-213ENST00000469300 4807 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.24e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LIMS2-210ENST00000413578 930 ntTSL 311.1□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 312.11□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 59.33□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 211.3□□□□□ -0.65e-11■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.43e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.493e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 48.71□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 STIM1-212ENST00000531332 561 ntTSL 213.26□□□□□ -0.295e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 STIM1-206ENST00000526596 1214 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.187e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 LARP4B-202ENST00000406525 681 ntTSL 525.36■■□□□ 1.657e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.17e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 313.82□□□□□ -0.27e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 LARP4B-208ENST00000481118 421 ntTSL 311.22□□□□□ -0.617e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.655e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 317.94■□□□□ 0.465e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 314.52□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 311.98□□□□□ -0.495e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 NPTN-206ENST00000563753 599 ntTSL 214.02□□□□□ -0.172e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 NPTN-207ENST00000564551 586 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 215.81■□□□□ 0.122e-14■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-14■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 513.34□□□□□ -0.272e-14■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.32e-14■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.622e-14■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21e-6■■■■□ 25.6
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