Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.248e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 APTX-207ENST00000397172 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 31.6
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