Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERGIC3Q9Y282 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERGIC3Q9Y282 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERGIC3Q9Y282 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms