Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 MGST2-206ENST00000515137 1013 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.996e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.425e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 NCLN-208ENST00000592737 2735 ntTSL 317.68■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 NCLN-203ENST00000587740 1210 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 NCLN-206ENST00000591062 460 ntTSL 514.81□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.792e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 218.22■□□□□ 0.512e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-9■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 415.58■□□□□ 0.086e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 214.55□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.046e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 46.87□□□□□ -1.316e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.356e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.6
STAU2Q9NUL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.021e-7■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-7■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-7■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-22■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-22■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-22■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 SELENOP-210ENST00000512980 4175 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-22■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-204ENST00000463591 384 ntTSL 520.57■□□□□ 0.886e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.26e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.166e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.026e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.256e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.46e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PTPRF-205ENST00000414879 4836 ntTSL 212.47□□□□□ -0.416e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 511.76□□□□□ -0.536e-6■□□□□ 10.5
STAU2Q9NUL3 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-11■□□□□ 10.4
STAU2Q9NUL3 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 417.22■□□□□ 0.353e-6■□□□□ 10.4
STAU2Q9NUL3 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 316.28■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 10.4
STAU2Q9NUL3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.515e-7■□□□□ 10.4
STAU2Q9NUL3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.335e-7■□□□□ 10.4
STAU2Q9NUL3 PHC2-210ENST00000485928 2548 ntTSL 223.56■■□□□ 1.364e-10■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.364e-10■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-10■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.464e-10■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-10■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 214.76□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 SLC35F6-203ENST00000429494 3738 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 SLC35F6-202ENST00000414029 3605 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 10.3
STAU2Q9NUL3 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 413.6□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 326.56■■□□□ 1.849e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 221.3■■□□□ 13e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.529e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 517.51■□□□□ 0.393e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 416.42■□□□□ 0.229e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.169e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 216.06■□□□□ 0.169e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.129e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 515.22■□□□□ 0.039e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 215.16■□□□□ 0.029e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 415.06■□□□□ 09e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-208ENST00000497889 824 ntTSL 514.57□□□□□ -0.089e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.169e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 214.03□□□□□ -0.169e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.199e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-206ENST00000474093 585 ntTSL 213.64□□□□□ -0.239e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.269e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 512.96□□□□□ -0.333e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.383e-8■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 211.73□□□□□ -0.539e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.779e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 39.92□□□□□ -0.829e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 PECR-204ENST00000464722 640 ntTSL 46.41□□□□□ -1.389e-6■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.573e-9■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 221.49■■□□□ 1.033e-9■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.953e-9■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.813e-9■□□□□ 10.2
STAU2Q9NUL3 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 518.96■□□□□ 0.633e-9■□□□□ 10.2
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