Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.557e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.627e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.217e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-213ENST00000503937 1564 ntTSL 1 (best)6.72□□□□□ -1.337e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.547e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.667e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.737e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.857e-15■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.253e-6■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.994e-11■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.64e-11■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-11■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-11■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-8■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-8■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-8■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.952e-8■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.322e-14■■■□□ 16.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5A1-204ENST00000586523 4547 nt6.22□□□□□ -1.412e-10■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-205ENST00000570772 582 ntTSL 310.81□□□□□ -0.683e-7■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.443e-8■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.443e-8■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC5L-203ENST00000465124 1877 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-8■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 33.44□□□□□ -1.863e-8■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 22.55□□□□□ -23e-8■■■□□ 16
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■□□ 15.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.05□□□□□ -1.923e-7■■■□□ 15.9
APOBEC3CQ9NRW3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.873e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.723e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.613e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.451e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-8■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 213.74□□□□□ -0.218e-9■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.238e-9■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.458e-9■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.623e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)24.12■■□□□ 1.453e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.453e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 323.29■■□□□ 1.323e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.033e-21■■■□□ 15.8
APOBEC3CQ9NRW3 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.48e-89■■■□□ 15.7
APOBEC3CQ9NRW3 KRT10-202ENST00000635956 583 ntTSL 223.8■■□□□ 1.46e-8■■■□□ 15.7
APOBEC3CQ9NRW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.336e-8■■■□□ 15.7
APOBEC3CQ9NRW3 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.221e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.771e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.221e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 225.04■■□□□ 1.61e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.571e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.531e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.241e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.031e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 321.21■□□□□ 0.991e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.841e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.671e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 519.02■□□□□ 0.641e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 218.92■□□□□ 0.621e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 318.92■□□□□ 0.621e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 518.35■□□□□ 0.531e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-227ENST00000529576 424 ntTSL 217.69■□□□□ 0.421e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 217.19■□□□□ 0.341e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 316.91■□□□□ 0.31e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 216.12■□□□□ 0.171e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 314.83□□□□□ -0.041e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 514.83□□□□□ -0.041e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.83□□□□□ -0.041e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.87□□□□□ -0.191e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 310.07□□□□□ -0.81e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 210.02□□□□□ -0.811e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.861e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 24.96□□□□□ -1.621e-9■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-323■■■□□ 15.6
APOBEC3CQ9NRW3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.336e-8■■■□□ 15.5
APOBEC3CQ9NRW3 CMAS-202ENST00000534981 1575 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.946e-8■■■□□ 15.5
APOBEC3CQ9NRW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.241e-9■■■□□ 15.5
APOBEC3CQ9NRW3 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-7■■■□□ 15.4
APOBEC3CQ9NRW3 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.75e-7■■■□□ 15.4
APOBEC3CQ9NRW3 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.785e-7■■■□□ 15.4
APOBEC3CQ9NRW3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-11■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 82.3 ms