Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 PSD4-211ENST00000487574 670 ntTSL 421.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TSC2-219ENST00000563346 553 ntTSL 220.92■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MIER2-205ENST00000619835 1748 ntTSL 320.87■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 GTF3C2-209ENST00000470115 653 ntTSL 519.82■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TTC14-209ENST00000491380 601 ntTSL 319.71■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 COL7A1-203ENST00000459756 818 ntTSL 519.53■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 N6AMT1-203ENST00000460212 1293 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TPRA1-210ENST00000490290 841 ntTSL 319.02■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-211ENST00000450041 649 ntTSL 518.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TET3-204ENST00000496886 710 ntTSL 318.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-210ENST00000581180 899 ntTSL 218.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RAC3-203ENST00000584341 730 ntTSL 518.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ALDH2-203ENST00000548536 1760 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 LRWD1-205ENST00000473880 5491 ntTSL 217.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-213ENST00000472155 2646 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-207ENST00000578789 568 ntTSL 417.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-211ENST00000581761 812 ntTSL 317.51■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 LGI4-203ENST00000473160 1102 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 417.48■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-216ENST00000496466 2339 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-215ENST00000494942 2325 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TPRA1-205ENST00000462228 713 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 PSD4-206ENST00000460725 2763 ntTSL 217.16■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-203ENST00000393120 1926 ntTSL 216.95■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 OTUD7B-201ENST00000417191 1425 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MATK-208ENST00000590493 801 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TSC2-210ENST00000463808 842 ntTSL 216.7■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 516.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-209ENST00000587721 731 ntTSL 416.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 EFR3A-204ENST00000520362 477 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-214ENST00000475591 2542 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 CAMTA2-207ENST00000572326 437 ntTSL 316.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MATK-206ENST00000588983 711 ntTSL 316.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-210ENST00000442942 688 ntTSL 216.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-209ENST00000423664 793 ntTSL 316.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-219ENST00000591960 1328 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 DHX37-203ENST00000539298 4550 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 LARP4-213ENST00000548697 587 ntTSL 516.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 NCOR2-209ENST00000440187 467 ntTSL 515.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TYRO3-208ENST00000568343 856 ntTSL 515.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ZC3H7B-202ENST00000486331 5262 ntTSL 215.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 INTS6-207ENST00000469430 3767 ntTSL 215.23■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 PSD4-208ENST00000465592 548 ntTSL 415.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-201ENST00000291892 3022 ntTSL 214.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-214ENST00000589605 584 ntTSL 514.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ATP9B-214ENST00000588772 453 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-212ENST00000452980 782 ntTSL 314.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 UBXN11-203ENST00000374215 938 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 GDPD5-212ENST00000531759 2633 ntTSL 514.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 RDH13-205ENST00000586945 601 ntTSL 513.61□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TSC2-218ENST00000562474 589 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-12■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TYW1-206ENST00000495971 1302 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 FAM114A1-206ENST00000515037 1431 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ABCB8-214ENST00000482899 3743 ntTSL 212.53□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 CYFIP1-213ENST00000621105 514 ntTSL 212.38□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TYRO3-205ENST00000560162 576 ntTSL 411.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 38.5
DDX24Q9GZR7 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 801.8 ms