RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568343.1

TYRO3-208, Transcript of TYRO3 protein tyrosine kinase, humanhuman

TSL 5

Gene TYRO3, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3-208ENST00000568343 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.83■■■□□ 2.69
TYRO3-208ENST00000568343 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.29■■■□□ 2.12
TYRO3-208ENST00000568343 ABCC9O60706 1549 aa28.15■■■□□ 2.1
TYRO3-208ENST00000568343 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.82■■□□□ 1.88
TYRO3-208ENST00000568343 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.8■■□□□ 1.88
TYRO3-208ENST00000568343 NACADO15069 1562 aa26.71■■□□□ 1.87
TYRO3-208ENST00000568343 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TYRO3-208ENST00000568343 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.44■■□□□ 1.82
TYRO3-208ENST00000568343 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
TYRO3-208ENST00000568343 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.24■■□□□ 1.79
TYRO3-208ENST00000568343 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.13■■□□□ 1.77
TYRO3-208ENST00000568343 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.09■■□□□ 1.77
TYRO3-208ENST00000568343 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.07■■□□□ 1.76
TYRO3-208ENST00000568343 SCRIBQ14160 1630 aa25.95■■□□□ 1.74
TYRO3-208ENST00000568343 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.68■■□□□ 1.7
TYRO3-208ENST00000568343 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TYRO3-208ENST00000568343 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.35■■□□□ 1.65
TYRO3-208ENST00000568343 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
TYRO3-208ENST00000568343 SMARCA4P51532 1647 aa24.72■■□□□ 1.55
TYRO3-208ENST00000568343 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.71■■□□□ 1.55
TYRO3-208ENST00000568343 NCAPD3P42695 1498 aa24.7■■□□□ 1.55
TYRO3-208ENST00000568343 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TYRO3-208ENST00000568343 SMARCA2P51531 1590 aa24.59■■□□□ 1.53
TYRO3-208ENST00000568343 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.58■■□□□ 1.52
TYRO3-208ENST00000568343 HMGXB3Q12766 1538 aa24.53■■□□□ 1.52
TYRO3-208ENST00000568343 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TYRO3-208ENST00000568343 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.46■■□□□ 1.51
TYRO3-208ENST00000568343 NESP48681 1621 aa24.28■■□□□ 1.48
TYRO3-208ENST00000568343 ERCC6Q03468 1493 aa24.25■■□□□ 1.47
TYRO3-208ENST00000568343 WIZO95785 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
TYRO3-208ENST00000568343 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TYRO3-208ENST00000568343 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.03■■□□□ 1.44
TYRO3-208ENST00000568343 CUX2O14529 1486 aa24.02■■□□□ 1.44
TYRO3-208ENST00000568343 CADPSQ9ULU8 1353 aa24■■□□□ 1.43
TYRO3-208ENST00000568343 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TYRO3-208ENST00000568343 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
TYRO3-208ENST00000568343 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TYRO3-208ENST00000568343 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.85■■□□□ 1.41
TYRO3-208ENST00000568343 CFTRP13569 1480 aa23.79■■□□□ 1.4
TYRO3-208ENST00000568343 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.75■■□□□ 1.39
TYRO3-208ENST00000568343 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.74■■□□□ 1.39
TYRO3-208ENST00000568343 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.74■■□□□ 1.39
TYRO3-208ENST00000568343 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.71■■□□□ 1.39
TYRO3-208ENST00000568343 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.65■■□□□ 1.38
TYRO3-208ENST00000568343 WDR62O43379 1518 aa23.64■■□□□ 1.38
TYRO3-208ENST00000568343 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TYRO3-208ENST00000568343 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TYRO3-208ENST00000568343 PRDM2Q13029 1718 aa23.36■■□□□ 1.33
TYRO3-208ENST00000568343 TOPBP1Q92547 1522 aa23.32■■□□□ 1.32
TYRO3-208ENST00000568343 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.23■■□□□ 1.31
TYRO3-208ENST00000568343 IFT140Q96RY7 1462 aa23.22■■□□□ 1.31
TYRO3-208ENST00000568343 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TYRO3-208ENST00000568343 ABCC8Q09428 1581 aa23.19■■□□□ 1.3
TYRO3-208ENST00000568343 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TYRO3-208ENST00000568343 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.06■■□□□ 1.28
TYRO3-208ENST00000568343 CUX1P39880 1505 aa23.06■■□□□ 1.28
TYRO3-208ENST00000568343 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TYRO3-208ENST00000568343 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 36.6
TYRO3-208ENST00000568343 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TYRO3-208ENST00000568343 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.03■■□□□ 1.28
TYRO3-208ENST00000568343 SOGA1O94964 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
TYRO3-208ENST00000568343 OSCARQ8IYS5 282 aa23■■□□□ 1.27
TYRO3-208ENST00000568343 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TYRO3-208ENST00000568343 TRIM41Q8WV44 630 aa22.85■■□□□ 1.25
TYRO3-208ENST00000568343 FBLN2P98095 1184 aa22.83■■□□□ 1.25
TYRO3-208ENST00000568343 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
TYRO3-208ENST00000568343 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.8■■□□□ 1.24
TYRO3-208ENST00000568343 SYNJ1O43426 1573 aa22.76■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 GRIN2BQ13224 1484 aa22.76■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.75■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 WDR97A6NE52 1622 aa22.75■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.72■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 TOP2BQ02880 1626 aa22.71■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 CHD1O14646 1710 aa22.71■■□□□ 1.23
TYRO3-208ENST00000568343 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.68■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.67■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 ARHGEF11O15085 1522 aa22.67■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.65■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.65■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.65■■□□□ 1.22
TYRO3-208ENST00000568343 SYNJ2O15056 1496 aa22.64■■□□□ 1.21
TYRO3-208ENST00000568343 PBRM1Q86U86 1689 aa22.58■■□□□ 1.21
TYRO3-208ENST00000568343 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
TYRO3-208ENST00000568343 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
TYRO3-208ENST00000568343 ARAP1Q96P48 1450 aa22.49■■□□□ 1.19
TYRO3-208ENST00000568343 ADAMTS12P58397 1594 aa22.49■■□□□ 1.19
TYRO3-208ENST00000568343 GRIN2AQ12879 1464 aa22.47■■□□□ 1.19
TYRO3-208ENST00000568343 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
TYRO3-208ENST00000568343 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.43■■□□□ 1.18
TYRO3-208ENST00000568343 NUP160Q12769 1436 aa22.39■■□□□ 1.17
TYRO3-208ENST00000568343 CEP170Q5SW79 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
TYRO3-208ENST00000568343 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
TYRO3-208ENST00000568343 IGF1RP08069 1367 aa22.31■■□□□ 1.16
TYRO3-208ENST00000568343 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.29■■□□□ 1.16
TYRO3-208ENST00000568343 SHROOM2Q13796 1616 aa22.18■■□□□ 1.14
TYRO3-208ENST00000568343 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TYRO3-208ENST00000568343 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.16■■□□□ 1.14
TYRO3-208ENST00000568343 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.14■■□□□ 1.14
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