Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PREX2Q70Z35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PREX2Q70Z35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PREX2Q70Z35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX2Q70Z35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PREX2Q70Z35 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms