Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.41■■■■■ 6.14
PREX2Q70Z35 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.93■■■■■ 6.06
PREX2Q70Z35 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.18■■■■■ 5.94
PREX2Q70Z35 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
PREX2Q70Z35 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
PREX2Q70Z35 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
PREX2Q70Z35 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
PREX2Q70Z35 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.02■■■■■ 5.76
PREX2Q70Z35 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
PREX2Q70Z35 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
PREX2Q70Z35 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.44■■■■■ 5.66
PREX2Q70Z35 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
PREX2Q70Z35 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
PREX2Q70Z35 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
PREX2Q70Z35 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.97■■■■■ 5.59
PREX2Q70Z35 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
PREX2Q70Z35 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
PREX2Q70Z35 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
PREX2Q70Z35 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
PREX2Q70Z35 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.39■■■■■ 5.5
PREX2Q70Z35 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
PREX2Q70Z35 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
PREX2Q70Z35 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
PREX2Q70Z35 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
PREX2Q70Z35 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
PREX2Q70Z35 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.41
PREX2Q70Z35 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.81■■■■■ 5.4
PREX2Q70Z35 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
PREX2Q70Z35 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.62■■■■■ 5.37
PREX2Q70Z35 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
PREX2Q70Z35 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
PREX2Q70Z35 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
PREX2Q70Z35 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
PREX2Q70Z35 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
PREX2Q70Z35 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
PREX2Q70Z35 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
PREX2Q70Z35 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
PREX2Q70Z35 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.85■■■■■ 5.25
PREX2Q70Z35 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
PREX2Q70Z35 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PREX2Q70Z35 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PREX2Q70Z35 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
PREX2Q70Z35 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
PREX2Q70Z35 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
PREX2Q70Z35 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PREX2Q70Z35 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.09■■■■■ 5.13
PREX2Q70Z35 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PREX2Q70Z35 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
PREX2Q70Z35 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
PREX2Q70Z35 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
PREX2Q70Z35 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
PREX2Q70Z35 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
PREX2Q70Z35 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
PREX2Q70Z35 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.07
PREX2Q70Z35 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.66■■■■■ 5.06
PREX2Q70Z35 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
PREX2Q70Z35 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
PREX2Q70Z35 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
PREX2Q70Z35 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
PREX2Q70Z35 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
PREX2Q70Z35 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
PREX2Q70Z35 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
PREX2Q70Z35 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5
PREX2Q70Z35 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
PREX2Q70Z35 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
PREX2Q70Z35 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
PREX2Q70Z35 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
PREX2Q70Z35 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
PREX2Q70Z35 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PREX2Q70Z35 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
PREX2Q70Z35 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
PREX2Q70Z35 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
PREX2Q70Z35 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
PREX2Q70Z35 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
PREX2Q70Z35 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
PREX2Q70Z35 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
PREX2Q70Z35 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
PREX2Q70Z35 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
PREX2Q70Z35 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.85■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
PREX2Q70Z35 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PREX2Q70Z35 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
PREX2Q70Z35 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
PREX2Q70Z35 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PREX2Q70Z35 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
PREX2Q70Z35 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
PREX2Q70Z35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PREX2Q70Z35 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.58■■■■■ 4.89
PREX2Q70Z35 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
PREX2Q70Z35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
PREX2Q70Z35 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
PREX2Q70Z35 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
PREX2Q70Z35 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
PREX2Q70Z35 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
PREX2Q70Z35 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms