RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293825.10

TNFSF12-201, Transcript of TNF superfamily member 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12, Length 1,553 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-201ENST00000293825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.64■■■■■ 6.98
TNFSF12-201ENST00000293825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.07■■■■■ 5.93
TNFSF12-201ENST00000293825 ABCC9O60706 1549 aa50.79■■■■■ 5.72
TNFSF12-201ENST00000293825 NACADO15069 1562 aa48.94■■■■■ 5.43
TNFSF12-201ENST00000293825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.94■■■■■ 5.43
TNFSF12-201ENST00000293825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.87■■■■■ 5.41
TNFSF12-201ENST00000293825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.86■■■■■ 5.41
TNFSF12-201ENST00000293825 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.74■■■■■ 5.39
TNFSF12-201ENST00000293825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.55■■■■■ 5.36
TNFSF12-201ENST00000293825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.85■■■■■ 5.25
TNFSF12-201ENST00000293825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
TNFSF12-201ENST00000293825 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.49■■■■■ 5.19
TNFSF12-201ENST00000293825 SCRIBQ14160 1630 aa47.47■■■■■ 5.19
TNFSF12-201ENST00000293825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.01■■■■■ 5.12
TNFSF12-201ENST00000293825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.56■■■■■ 5.04
TNFSF12-201ENST00000293825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
TNFSF12-201ENST00000293825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.98■■■■■ 4.95
TNFSF12-201ENST00000293825 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.65■■■■■ 4.9
TNFSF12-201ENST00000293825 SMARCA4P51532 1647 aa45.46■■■■■ 4.87
TNFSF12-201ENST00000293825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
TNFSF12-201ENST00000293825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
TNFSF12-201ENST00000293825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.2■■■■■ 4.83
TNFSF12-201ENST00000293825 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.18■■■■■ 4.82
TNFSF12-201ENST00000293825 NCAPD3P42695 1498 aa45.18■■■■■ 4.82
TNFSF12-201ENST00000293825 SMARCA2P51531 1590 aa45.14■■■■■ 4.82
TNFSF12-201ENST00000293825 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.06■■■■■ 4.8
TNFSF12-201ENST00000293825 HMGXB3Q12766 1538 aa44.95■■■■■ 4.79
TNFSF12-201ENST00000293825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
TNFSF12-201ENST00000293825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
TNFSF12-201ENST00000293825 WIZO95785 1651 aa44.69■■■■■ 4.74
TNFSF12-201ENST00000293825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
TNFSF12-201ENST00000293825 NESP48681 1621 aa44■■■■■ 4.63
TNFSF12-201ENST00000293825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.94■■■■■ 4.62
TNFSF12-201ENST00000293825 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.85■■■■■ 4.61
TNFSF12-201ENST00000293825 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
TNFSF12-201ENST00000293825 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.71■■■■■ 4.59
TNFSF12-201ENST00000293825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.63■■■■■ 4.58
TNFSF12-201ENST00000293825 CFTRP13569 1480 aa43.63■■■■■ 4.57
TNFSF12-201ENST00000293825 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.61■■■■■ 4.57
TNFSF12-201ENST00000293825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.49■■■■■ 4.55
TNFSF12-201ENST00000293825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
TNFSF12-201ENST00000293825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.32■■■■■ 4.53
TNFSF12-201ENST00000293825 CUX2O14529 1486 aa43.29■■■■■ 4.52
TNFSF12-201ENST00000293825 PRDM2Q13029 1718 aa43.28■■■■■ 4.52
TNFSF12-201ENST00000293825 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.25■■■■■ 4.51
TNFSF12-201ENST00000293825 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.16■■■■■ 4.5
TNFSF12-201ENST00000293825 WDR62O43379 1518 aa43.04■■■■■ 4.48
TNFSF12-201ENST00000293825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
TNFSF12-201ENST00000293825 ABCC8Q09428 1581 aa42.68■■■■■ 4.42
TNFSF12-201ENST00000293825 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
TNFSF12-201ENST00000293825 TRIM41Q8WV44 630 aa42.61■■■■■ 4.41
TNFSF12-201ENST00000293825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.6■■■■■ 4.41
TNFSF12-201ENST00000293825 CUX1P39880 1505 aa42.38■■■■■ 4.37
TNFSF12-201ENST00000293825 IFT140Q96RY7 1462 aa42.35■■■■■ 4.37
TNFSF12-201ENST00000293825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
TNFSF12-201ENST00000293825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
TNFSF12-201ENST00000293825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.35
TNFSF12-201ENST00000293825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
TNFSF12-201ENST00000293825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
TNFSF12-201ENST00000293825 SOGA1O94964 1423 aa42.13■■■■■ 4.33
TNFSF12-201ENST00000293825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.09■■■■■ 4.33
TNFSF12-201ENST00000293825 TOP2BQ02880 1626 aa42.05■■■■■ 4.32
TNFSF12-201ENST00000293825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.04■■■■■ 4.32
TNFSF12-201ENST00000293825 SYNJ1O43426 1573 aa42.03■■■■■ 4.32
TNFSF12-201ENST00000293825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
TNFSF12-201ENST00000293825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
TNFSF12-201ENST00000293825 WDR97A6NE52 1622 aa41.87■■■■■ 4.29
TNFSF12-201ENST00000293825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
TNFSF12-201ENST00000293825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.84■■■■■ 4.29
TNFSF12-201ENST00000293825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.83■■■■■ 4.29
TNFSF12-201ENST00000293825 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.8■■■■■ 4.28
TNFSF12-201ENST00000293825 EEA1Q15075 1411 aa41.75■■■■■ 4.27
TNFSF12-201ENST00000293825 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.64■■■■■ 4.26
TNFSF12-201ENST00000293825 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TNFSF12-201ENST00000293825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.64■■■■■ 4.26
TNFSF12-201ENST00000293825 GRIN2BQ13224 1484 aa41.61■■■■■ 4.25
TNFSF12-201ENST00000293825 OSCARQ8IYS5 282 aa41.54■■■■■ 4.24
TNFSF12-201ENST00000293825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.52■■■■■ 4.24
TNFSF12-201ENST00000293825 PBRM1Q86U86 1689 aa41.52■■■■■ 4.24
TNFSF12-201ENST00000293825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
TNFSF12-201ENST00000293825 CHD1O14646 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
TNFSF12-201ENST00000293825 FBLN2P98095 1184 aa41.36■■■■■ 4.21
TNFSF12-201ENST00000293825 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
TNFSF12-201ENST00000293825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.33■■■■■ 4.21
TNFSF12-201ENST00000293825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
TNFSF12-201ENST00000293825 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.28■■■■■ 4.2
TNFSF12-201ENST00000293825 KIF27Q86VH2 1401 aa41.26■■■■■ 4.2
TNFSF12-201ENST00000293825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.23■■■■■ 4.19
TNFSF12-201ENST00000293825 ADAMTS12P58397 1594 aa41.21■■■■■ 4.19
TNFSF12-201ENST00000293825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.17■■■■■ 4.18
TNFSF12-201ENST00000293825 KIF21BO75037 1637 aa41.11■■■■■ 4.17
TNFSF12-201ENST00000293825 IGF1RP08069 1367 aa41.11■■■■■ 4.17
TNFSF12-201ENST00000293825 GRIN2AQ12879 1464 aa41.08■■■■■ 4.17
TNFSF12-201ENST00000293825 GOLGA3Q08378 1498 aa41.08■■■■■ 4.17
TNFSF12-201ENST00000293825 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.02■■■■■ 4.16
TNFSF12-201ENST00000293825 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.99■■■■■ 4.15
TNFSF12-201ENST00000293825 CUL7Q14999 1698 aa40.96■■■■■ 4.15
TNFSF12-201ENST00000293825 NUP160Q12769 1436 aa40.92■■■■■ 4.14
TNFSF12-201ENST00000293825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.89■■■■■ 4.14
TNFSF12-201ENST00000293825 CEP170Q5SW79 1584 aa40.87■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms