Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)6.22□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 55.74□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 SSBP3-214ENST00000533209 552 ntTSL 412.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 163.2
UTP3Q9NQZ2 FAM102A-206ENST00000493175 423 ntTSL 313.45□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 163.1
UTP3Q9NQZ2 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 225.38■■□□□ 1.654e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 523.95■■□□□ 1.426e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CDK5-202ENST00000469108 582 ntTSL 323.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.226e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 320.27■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.54e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 517.99■□□□□ 0.474e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 DYNC1LI2-206ENST00000564090 566 ntTSL 417.74■□□□□ 0.434e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 DYNC1LI2-210ENST00000566150 568 ntTSL 317.74■□□□□ 0.434e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-202ENST00000517814 563 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 ZBTB17-213ENST00000490899 675 ntTSL 316.61■□□□□ 0.254e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 315.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 315.37■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-207ENST00000521703 833 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 213.6□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CDK5-205ENST00000487703 922 ntTSL 512.93□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-203ENST00000517820 796 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.364e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-206ENST00000521071 683 ntTSL 212.63□□□□□ -0.394e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 ZBTB17-206ENST00000464719 485 ntTSL 312.16□□□□□ -0.464e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CD55-210ENST00000634386 951 ntTSL 510.24□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-209ENST00000524128 620 ntTSL 36.52□□□□□ -1.374e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)6.48□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.584e-21■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 516.79■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 316.79■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-228ENST00000509552 2304 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-213ENST00000480060 601 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 163
UTP3Q9NQZ2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 162.9
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 225.48■■□□□ 1.676e-7■■■■■ 162.8
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 225.41■■□□□ 1.666e-7■■■■■ 162.8
UTP3Q9NQZ2 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 514.27□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 162.7
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-219ENST00000585573 319 ntTSL 312.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 162.6
UTP3Q9NQZ2 WWP2-217ENST00000569297 2462 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 162.6
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-214ENST00000558863 1355 ntTSL 526.07■■□□□ 1.766e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-204ENST00000455394 5462 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-203ENST00000417737 5452 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-218ENST00000560196 1014 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 FMNL1-205ENST00000586643 1475 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-206ENST00000488625 6026 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-211ENST00000558440 886 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-204ENST00000437844 6246 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-222ENST00000561212 1500 ntTSL 57.92□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-223ENST00000561304 1383 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-203ENST00000424869 887 ntTSL 57.87□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-217ENST00000559858 2745 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 SEC24D-210ENST00000511033 576 ntTSL 46.29□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-209ENST00000542879 3645 ntTSL 25.95□□□□□ -1.466e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 162.5
UTP3Q9NQZ2 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 521.76■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 162.4
UTP3Q9NQZ2 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 310.23□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 162.4
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 162.3
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 162.3
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 162.3
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 162.3
UTP3Q9NQZ2 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.04□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 162.3
UTP3Q9NQZ2 MCM5-207ENST00000464908 554 ntTSL 414.56□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 162.2
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 317.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 162.1
UTP3Q9NQZ2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 162.1
UTP3Q9NQZ2 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 162
UTP3Q9NQZ2 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 162
UTP3Q9NQZ2 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 162
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 161.9
UTP3Q9NQZ2 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 318.41■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 161.9
UTP3Q9NQZ2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.376e-9■■■■■ 161.9
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-214ENST00000490681 560 ntTSL 414.95□□□□□ -0.026e-9■■■■■ 161.9
UTP3Q9NQZ2 MCPH1-AS1-202ENST00000522897 523 ntTSL 416.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 161.8
UTP3Q9NQZ2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 161.8
UTP3Q9NQZ2 MCPH1-AS1-204ENST00000527490 543 ntTSL 314.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 161.8
UTP3Q9NQZ2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 161.8
UTP3Q9NQZ2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 HACE1-204ENST00000416605 4729 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-14■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-204ENST00000413082 672 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-14■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-14■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-205ENST00000466152 1097 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.772e-14■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-14■■■■■ 161.7
UTP3Q9NQZ2 DPM1-206ENST00000494752 789 ntTSL 39.71□□□□□ -0.862e-14■■■■■ 161.7
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