Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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USP43Q70EL4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP43Q70EL4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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