RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616360.1

TSC22D1-AS1-201, TSC22D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC22D1-AS1, Length 2,845 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.5■■■■□ 3.27
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.36■■■□□ 2.45
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.67■■■□□ 2.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.99■■■□□ 2.23
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.68■■■□□ 2.18
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.62■■■□□ 2.17
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HRCP23327 699 aa28.57■■■□□ 2.16
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SCRIBQ14160 1630 aa28.43■■■□□ 2.14
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ABCC9O60706 1549 aa28.29■■■□□ 2.12
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.24■■■□□ 2.11
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.94■■■□□ 2.06
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NACADO15069 1562 aa27.93■■■□□ 2.06
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.82■■■□□ 2.04
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.81■■■□□ 2.04
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.67■■■□□ 2.02
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 WIZO95785 1651 aa27.54■■■□□ 2
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TRIM41Q8WV44 630 aa27.53■■■□□ 2
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.33■■□□□ 1.97
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.27■■□□□ 1.96
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.91■■□□□ 1.9
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ABCC8Q09428 1581 aa26.89■■□□□ 1.9
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SMARCA2P51531 1590 aa26.88■■□□□ 1.89
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SOGA1O94964 1423 aa26.59■■□□□ 1.85
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.43■■□□□ 1.82
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.34■■□□□ 1.81
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CEP162Q5TB80 1403 aa26.32■■□□□ 1.8
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NEUROD1Q13562 356 aa26.31■■□□□ 1.8
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.22■■□□□ 1.79
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 EEA1Q15075 1411 aa26.2■■□□□ 1.78
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.13■■□□□ 1.77
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 GOLGA3Q08378 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TOP2BQ02880 1626 aa25.89■■□□□ 1.74
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NCAPD3P42695 1498 aa25.89■■□□□ 1.73
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CLIP1P30622 1438 aa25.86■■□□□ 1.73
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HMGXB3Q12766 1538 aa25.84■■□□□ 1.73
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.79■■□□□ 1.72
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CUX1P39880 1505 aa25.75■■□□□ 1.71
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TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.69■■□□□ 1.7
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CFTRP13569 1480 aa25.66■■□□□ 1.7
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PRXQ9BXM0 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 APLP2Q06481 763 aa25.55■■□□□ 1.68
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KIF27Q86VH2 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ARAP1Q96P48 1450 aa25.49■■□□□ 1.67
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MIER1Q8N108 512 aa25.45■■□□□ 1.66
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.42■■□□□ 1.66
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.42■■□□□ 1.66
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PRDM2Q13029 1718 aa25.41■■□□□ 1.66
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CUX2O14529 1486 aa25.37■■□□□ 1.65
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 IGF1RP08069 1367 aa25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.2■■□□□ 1.63
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NESP48681 1621 aa25.2■■□□□ 1.62
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 P3H3Q8IVL6 736 aa25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ITGAEP38570 1179 aa25.08■■□□□ 1.61
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.05■■□□□ 1.6
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TOPBP1Q92547 1522 aa25.03■■□□□ 1.6
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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