RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446281.5

LMCD1-AS1-204, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 932 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.45■■■■■ 4.87
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.96■■■■□ 3.99
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCC9O60706 1549 aa38.27■■■■□ 3.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.64■■■■□ 3.62
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.64■■■■□ 3.62
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.46■■■■□ 3.59
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NACADO15069 1562 aa37.38■■■■□ 3.57
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.19■■■■□ 3.54
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SCRIBQ14160 1630 aa36.56■■■■□ 3.44
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.5■■■■□ 3.43
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.31■■■■□ 3.4
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.04■■■■□ 3.36
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.32■■■■□ 3.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SMARCA4P51532 1647 aa35.06■■■■□ 3.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.05■■■■□ 3.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 WIZO95785 1651 aa34.71■■■■□ 3.15
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.7■■■■□ 3.14
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.65■■■■□ 3.14
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SMARCA2P51531 1590 aa34.64■■■■□ 3.14
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.63■■■■□ 3.13
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NCAPD3P42695 1498 aa34.5■■■■□ 3.11
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HMGXB3Q12766 1538 aa34.39■■■■□ 3.1
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.31■■■■□ 3.08
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.01■■■■□ 3.04
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.55■■■□□ 2.96
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CFTRP13569 1480 aa33.53■■■□□ 2.96
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.42■■■□□ 2.94
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NESP48681 1621 aa33.39■■■□□ 2.93
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PRDM2Q13029 1718 aa33.28■■■□□ 2.92
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.19■■■□□ 2.9
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.15■■■□□ 2.9
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.07■■■□□ 2.88
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCC8Q09428 1581 aa33.04■■■□□ 2.88
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.02■■■□□ 2.88
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.97■■■□□ 2.87
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ERCC6Q03468 1493 aa32.9■■■□□ 2.86
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRIM41Q8WV44 630 aa32.85■■■□□ 2.85
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SYNJ1O43426 1573 aa32.82■■■□□ 2.84
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CUX1P39880 1505 aa32.82■■■□□ 2.84
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.78■■■□□ 2.84
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TOP2BQ02880 1626 aa32.77■■■□□ 2.84
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.76■■■□□ 2.83
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.75■■■□□ 2.83
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TOPBP1Q92547 1522 aa32.72■■■□□ 2.83
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 WDR62O43379 1518 aa32.62■■■□□ 2.81
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.57■■■□□ 2.8
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SOGA1O94964 1423 aa32.42■■■□□ 2.78
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.37■■■□□ 2.77
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CUX2O14529 1486 aa32.36■■■□□ 2.77
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.3■■■□□ 2.76
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 IFT140Q96RY7 1462 aa32.29■■■□□ 2.76
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 WDR97A6NE52 1622 aa32.22■■■□□ 2.75
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.21■■■□□ 2.75
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EEA1Q15075 1411 aa32.21■■■□□ 2.75
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF27Q86VH2 1401 aa32.2■■■□□ 2.75
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.07■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.06■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.03■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.02■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 IGF1RP08069 1367 aa31.97■■■□□ 2.71
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.92■■■□□ 2.7
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GRIN2BQ13224 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PBRM1Q86U86 1689 aa31.88■■■□□ 2.69
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PRXQ9BXM0 1461 aa31.83■■■□□ 2.69
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.81■■■□□ 2.68
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CUL7Q14999 1698 aa31.8■■■□□ 2.68
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF21BO75037 1637 aa31.78■■■□□ 2.68
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.74■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.72■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.71■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.71■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GOLGA3Q08378 1498 aa31.7■■■□□ 2.66
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADAMTS12P58397 1594 aa31.69■■■□□ 2.66
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.67■■■□□ 2.66
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SYNJ2O15056 1496 aa31.59■■■□□ 2.65
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GRIN2AQ12879 1464 aa31.49■■■□□ 2.63
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.48■■■□□ 2.63
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FBLN2P98095 1184 aa31.47■■■□□ 2.63
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.46■■■□□ 2.63
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CHD1O14646 1710 aa31.37■■■□□ 2.61
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