RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535601.5

HTATSF1-204, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 3,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-204ENST00000535601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.92■■■■□ 3.98
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HTATSF1-204ENST00000535601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1-204ENST00000535601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
HTATSF1-204ENST00000535601 ABCC9O60706 1549 aa32.71■■■□□ 2.83
HTATSF1-204ENST00000535601 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1-204ENST00000535601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1-204ENST00000535601 SCRIBQ14160 1630 aa32.2■■■□□ 2.74
HTATSF1-204ENST00000535601 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1-204ENST00000535601 NACADO15069 1562 aa31.85■■■□□ 2.69
HTATSF1-204ENST00000535601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.58■■■□□ 2.65
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HTATSF1-204ENST00000535601 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1-204ENST00000535601 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1-204ENST00000535601 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-204ENST00000535601 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.09■■■□□ 2.57
HTATSF1-204ENST00000535601 WIZO95785 1651 aa30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1-204ENST00000535601 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.81■■■□□ 2.52
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HTATSF1-204ENST00000535601 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-204ENST00000535601 TRIM41Q8WV44 630 aa30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-204ENST00000535601 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
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HTATSF1-204ENST00000535601 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-204ENST00000535601 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.2■■■□□ 2.42
HTATSF1-204ENST00000535601 SMARCA2P51531 1590 aa30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1-204ENST00000535601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.01■■■□□ 2.4
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HTATSF1-204ENST00000535601 ABCC8Q09428 1581 aa29.97■■■□□ 2.39
HTATSF1-204ENST00000535601 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1-204ENST00000535601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1-204ENST00000535601 NCAPD3P42695 1498 aa29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1-204ENST00000535601 SOGA1O94964 1423 aa29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1-204ENST00000535601 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1-204ENST00000535601 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1-204ENST00000535601 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1-204ENST00000535601 HMGXB3Q12766 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1-204ENST00000535601 SYNJ1O43426 1573 aa29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1-204ENST00000535601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1-204ENST00000535601 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
HTATSF1-204ENST00000535601 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.16■■■□□ 2.26
HTATSF1-204ENST00000535601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-204ENST00000535601 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-204ENST00000535601 CFTRP13569 1480 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-204ENST00000535601 TOP2BQ02880 1626 aa28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1-204ENST00000535601 CUX1P39880 1505 aa28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1-204ENST00000535601 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1-204ENST00000535601 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1-204ENST00000535601 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1-204ENST00000535601 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1-204ENST00000535601 EEA1Q15075 1411 aa28.92■■■□□ 2.22
HTATSF1-204ENST00000535601 NESP48681 1621 aa28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1-204ENST00000535601 CEP162Q5TB80 1403 aa28.89■■■□□ 2.21
HTATSF1-204ENST00000535601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1-204ENST00000535601 GOLGA3Q08378 1498 aa28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-204ENST00000535601 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.8■■■□□ 2.2
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HTATSF1-204ENST00000535601 PRDM2Q13029 1718 aa28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1-204ENST00000535601 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1-204ENST00000535601 HRCP23327 699 aa28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1-204ENST00000535601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-204ENST00000535601 KIF21BO75037 1637 aa28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1-204ENST00000535601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-204ENST00000535601 CUX2O14529 1486 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-204ENST00000535601 KIF27Q86VH2 1401 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-204ENST00000535601 CLIP1P30622 1438 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-204ENST00000535601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.49■■■□□ 2.15
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HTATSF1-204ENST00000535601 TOPBP1Q92547 1522 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-204ENST00000535601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-204ENST00000535601 IGF1RP08069 1367 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-204ENST00000535601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-204ENST00000535601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
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HTATSF1-204ENST00000535601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.34■■■□□ 2.13
HTATSF1-204ENST00000535601 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-204ENST00000535601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.25■■■□□ 2.11
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HTATSF1-204ENST00000535601 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-204ENST00000535601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-204ENST00000535601 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HTATSF1-204ENST00000535601 ARAP1Q96P48 1450 aa28.16■■■□□ 2.1
HTATSF1-204ENST00000535601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.15■■■□□ 2.1
HTATSF1-204ENST00000535601 APLP2Q06481 763 aa28.14■■■□□ 2.1
HTATSF1-204ENST00000535601 P3H3Q8IVL6 736 aa28.13■■■□□ 2.09
HTATSF1-204ENST00000535601 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.06■■■□□ 2.08
HTATSF1-204ENST00000535601 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-204ENST00000535601 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-204ENST00000535601 WDR97A6NE52 1622 aa27.98■■■□□ 2.07
HTATSF1-204ENST00000535601 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1-204ENST00000535601 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HTATSF1-204ENST00000535601 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
HTATSF1-204ENST00000535601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.062e-8■■■■■ 35.8
HTATSF1-204ENST00000535601 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.89■■■□□ 2.06
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HTATSF1-204ENST00000535601 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1-204ENST00000535601 ERCC6Q03468 1493 aa27.85■■■□□ 2.05
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