Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX13Q9Y5W8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX13Q9Y5W8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX13Q9Y5W8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX13Q9Y5W8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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