Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SNX13Q9Y5W8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNX13Q9Y5W8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNX13Q9Y5W8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SNX13Q9Y5W8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX13Q9Y5W8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNX13Q9Y5W8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNX13Q9Y5W8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX13Q9Y5W8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX13Q9Y5W8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX13Q9Y5W8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX13Q9Y5W8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNX13Q9Y5W8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX13Q9Y5W8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX13Q9Y5W8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNX13Q9Y5W8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX13Q9Y5W8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX13Q9Y5W8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX13Q9Y5W8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX13Q9Y5W8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX13Q9Y5W8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX13Q9Y5W8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX13Q9Y5W8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX13Q9Y5W8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX13Q9Y5W8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX13Q9Y5W8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX13Q9Y5W8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX13Q9Y5W8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX13Q9Y5W8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX13Q9Y5W8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX13Q9Y5W8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX13Q9Y5W8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX13Q9Y5W8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX13Q9Y5W8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX13Q9Y5W8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX13Q9Y5W8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX13Q9Y5W8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX13Q9Y5W8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX13Q9Y5W8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX13Q9Y5W8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX13Q9Y5W8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX13Q9Y5W8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX13Q9Y5W8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX13Q9Y5W8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX13Q9Y5W8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX13Q9Y5W8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX13Q9Y5W8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX13Q9Y5W8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX13Q9Y5W8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX13Q9Y5W8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX13Q9Y5W8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX13Q9Y5W8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX13Q9Y5W8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX13Q9Y5W8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX13Q9Y5W8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX13Q9Y5W8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX13Q9Y5W8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX13Q9Y5W8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX13Q9Y5W8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX13Q9Y5W8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX13Q9Y5W8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX13Q9Y5W8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX13Q9Y5W8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX13Q9Y5W8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX13Q9Y5W8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX13Q9Y5W8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX13Q9Y5W8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX13Q9Y5W8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX13Q9Y5W8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX13Q9Y5W8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX13Q9Y5W8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX13Q9Y5W8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX13Q9Y5W8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX13Q9Y5W8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX13Q9Y5W8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX13Q9Y5W8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX13Q9Y5W8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX13Q9Y5W8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX13Q9Y5W8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX13Q9Y5W8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX13Q9Y5W8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX13Q9Y5W8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX13Q9Y5W8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX13Q9Y5W8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX13Q9Y5W8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX13Q9Y5W8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX13Q9Y5W8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX13Q9Y5W8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX13Q9Y5W8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX13Q9Y5W8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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