Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRB2Q5IJ48 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRB2Q5IJ48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRB2Q5IJ48 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRB2Q5IJ48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms