Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIDA1Q1XH10 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIDA1Q1XH10 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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