Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF1O43189 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF1O43189 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF1O43189 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF1O43189 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF1O43189 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF1O43189 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF1O43189 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF1O43189 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF1O43189 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF1O43189 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF1O43189 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF1O43189 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF1O43189 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF1O43189 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF1O43189 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF1O43189 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF1O43189 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF1O43189 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF1O43189 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF1O43189 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF1O43189 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF1O43189 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF1O43189 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF1O43189 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF1O43189 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF1O43189 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF1O43189 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF1O43189 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF1O43189 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF1O43189 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PHF1O43189 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF1O43189 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF1O43189 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF1O43189 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms