RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513063.5

MXD3-208, Transcript of MAX dimerization protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MXD3, Length 861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3-208ENST00000513063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.39■■■■■ 7.26
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MXD3-208ENST00000513063 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.48■■■■■ 6.31
MXD3-208ENST00000513063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.11■■■■■ 5.93
MXD3-208ENST00000513063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.94■■■■■ 5.91
MXD3-208ENST00000513063 NACADO15069 1562 aa51.6■■■■■ 5.85
MXD3-208ENST00000513063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.2■■■■■ 5.79
MXD3-208ENST00000513063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.05■■■■■ 5.763e-7■■■■□ 21.4
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MXD3-208ENST00000513063 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.68■■■■■ 5.7
MXD3-208ENST00000513063 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.57■■■■■ 5.69
MXD3-208ENST00000513063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
MXD3-208ENST00000513063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.87■■■■■ 5.57
MXD3-208ENST00000513063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.85■■■■■ 5.57
MXD3-208ENST00000513063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.63■■■■■ 5.54
MXD3-208ENST00000513063 SCRIBQ14160 1630 aa49.62■■■■■ 5.53
MXD3-208ENST00000513063 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.57■■■■■ 5.53
MXD3-208ENST00000513063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.4■■■■■ 5.5
MXD3-208ENST00000513063 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.11■■■■■ 5.29
MXD3-208ENST00000513063 CUX2O14529 1486 aa47.6■■■■■ 5.21
MXD3-208ENST00000513063 NCAPD3P42695 1498 aa47.6■■■■■ 5.21
MXD3-208ENST00000513063 ERCC6Q03468 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
MXD3-208ENST00000513063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.4■■■■■ 5.18
MXD3-208ENST00000513063 SMARCA2P51531 1590 aa47.28■■■■■ 5.16
MXD3-208ENST00000513063 SMARCA4P51532 1647 aa47.26■■■■■ 5.16
MXD3-208ENST00000513063 HMGXB3Q12766 1538 aa47.25■■■■■ 5.16
MXD3-208ENST00000513063 NESP48681 1621 aa47.06■■■■■ 5.12
MXD3-208ENST00000513063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
MXD3-208ENST00000513063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.11
MXD3-208ENST00000513063 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.77■■■■■ 5.08
MXD3-208ENST00000513063 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
MXD3-208ENST00000513063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.68■■■■■ 5.06
MXD3-208ENST00000513063 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.53■■■■■ 5.04
MXD3-208ENST00000513063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.48■■■■■ 5.03
MXD3-208ENST00000513063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.4■■■■■ 5.02
MXD3-208ENST00000513063 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.14■■■■■ 4.98
MXD3-208ENST00000513063 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.05■■■■■ 4.96
MXD3-208ENST00000513063 WIZO95785 1651 aa45.98■■■■■ 4.95
MXD3-208ENST00000513063 WDR62O43379 1518 aa45.95■■■■■ 4.95
MXD3-208ENST00000513063 TRIM41Q8WV44 630 aa45.84■■■■■ 4.93
MXD3-208ENST00000513063 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.77■■■■■ 4.92
MXD3-208ENST00000513063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.65■■■■■ 4.9
MXD3-208ENST00000513063 CFTRP13569 1480 aa45.5■■■■■ 4.87
MXD3-208ENST00000513063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
MXD3-208ENST00000513063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
MXD3-208ENST00000513063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
MXD3-208ENST00000513063 OSCARQ8IYS5 282 aa45.29■■■■■ 4.84
MXD3-208ENST00000513063 PRDM2Q13029 1718 aa45.09■■■■■ 4.81
MXD3-208ENST00000513063 IFT140Q96RY7 1462 aa44.85■■■■■ 4.77
MXD3-208ENST00000513063 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MXD3-208ENST00000513063 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MXD3-208ENST00000513063 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
MXD3-208ENST00000513063 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
MXD3-208ENST00000513063 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.81■■■■■ 4.76
MXD3-208ENST00000513063 TOPBP1Q92547 1522 aa44.73■■■■■ 4.75
MXD3-208ENST00000513063 ARHGEF11O15085 1522 aa44.62■■■■■ 4.73
MXD3-208ENST00000513063 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
MXD3-208ENST00000513063 ABCC8Q09428 1581 aa44.59■■■■■ 4.73
MXD3-208ENST00000513063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.53■■■■■ 4.72
MXD3-208ENST00000513063 CHD1O14646 1710 aa44.38■■■■■ 4.69
MXD3-208ENST00000513063 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
MXD3-208ENST00000513063 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.34■■■■■ 4.699e-9■■■■□ 22.1
MXD3-208ENST00000513063 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.28■■■■■ 4.68
MXD3-208ENST00000513063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
MXD3-208ENST00000513063 FBLN2P98095 1184 aa44.18■■■■■ 4.66
MXD3-208ENST00000513063 ARAP1Q96P48 1450 aa44.14■■■■■ 4.66
MXD3-208ENST00000513063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
MXD3-208ENST00000513063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.07■■■■■ 4.65
MXD3-208ENST00000513063 SOGA1O94964 1423 aa44■■■■■ 4.63
MXD3-208ENST00000513063 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
MXD3-208ENST00000513063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
MXD3-208ENST00000513063 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.92■■■■■ 4.62
MXD3-208ENST00000513063 WDR97A6NE52 1622 aa43.91■■■■■ 4.62
MXD3-208ENST00000513063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.89■■■■■ 4.62
MXD3-208ENST00000513063 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
MXD3-208ENST00000513063 SYNJ1O43426 1573 aa43.78■■■■■ 4.6
MXD3-208ENST00000513063 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
MXD3-208ENST00000513063 CUX1P39880 1505 aa43.75■■■■■ 4.59
MXD3-208ENST00000513063 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
MXD3-208ENST00000513063 GRIN2BQ13224 1484 aa43.7■■■■■ 4.59
MXD3-208ENST00000513063 SYNJ2O15056 1496 aa43.63■■■■■ 4.57
MXD3-208ENST00000513063 PBRM1Q86U86 1689 aa43.56■■■■■ 4.56
MXD3-208ENST00000513063 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.47■■■■■ 4.55
MXD3-208ENST00000513063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.37■■■■■ 4.53
MXD3-208ENST00000513063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.35■■■■■ 4.53
MXD3-208ENST00000513063 GRIN2AQ12879 1464 aa43.15■■■■■ 4.5
MXD3-208ENST00000513063 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
MXD3-208ENST00000513063 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.1■■■■■ 4.49
MXD3-208ENST00000513063 ADAMTS12P58397 1594 aa43.09■■■■■ 4.49
MXD3-208ENST00000513063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
MXD3-208ENST00000513063 CEP170Q5SW79 1584 aa43.03■■■■■ 4.48
MXD3-208ENST00000513063 NUP160Q12769 1436 aa43■■■■■ 4.47
MXD3-208ENST00000513063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.95■■■■■ 4.47
MXD3-208ENST00000513063 TOP2BQ02880 1626 aa42.93■■■■■ 4.46
MXD3-208ENST00000513063 SHROOM2Q13796 1616 aa42.9■■■■■ 4.46
MXD3-208ENST00000513063 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.9■■■■■ 4.46
MXD3-208ENST00000513063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
MXD3-208ENST00000513063 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
MXD3-208ENST00000513063 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.63■■■■■ 4.41
MXD3-208ENST00000513063 JPH4Q96JJ6 628 aa42.53■■■■■ 4.4
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