Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 32.9
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PRPF4O43172 BCKDK-208ENST00000567530 1796 ntTSL 520.88■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 BCKDK-207ENST00000566568 2558 ntTSL 517.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 BCKDK-205ENST00000484226 754 ntTSL 312.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.45e-29■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 523.95■■□□□ 1.425e-8■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 322.15■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.915e-8■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.915e-8■■■■■ 32.8
PRPF4O43172 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 321.27■■□□□ 12e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 419.78■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 32.7
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PRPF4O43172 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 217.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 417.38■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 410.13□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-214ENST00000519635 578 ntTSL 48.36□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 47.65□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 32.7
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PRPF4O43172 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 47.33□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 32.7
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PRPF4O43172 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 513.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 TNPO2-213ENST00000589149 564 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-14■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.176e-8■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 32.7
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PRPF4O43172 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 32.7
PRPF4O43172 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 32.7
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PRPF4O43172 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 32.4
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PRPF4O43172 VPS52-219ENST00000493379 786 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-201ENST00000339217 953 ntTSL 324.96■■□□□ 1.592e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-216ENST00000487164 1060 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 316.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 32.4
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PRPF4O43172 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 TCEA2-211ENST00000470559 296 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 319.99■□□□□ 0.792e-18■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-18■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-18■■■■■ 32.4
PRPF4O43172 FAM76B-212ENST00000545654 2001 ntTSL 226.07■■□□□ 1.763e-13■■■■■ 32.4
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