RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376557.3

PRR3-201, Transcript of proline rich 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRR3, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR3-201ENST00000376557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.76■■■□□ 2.51
PRR3-201ENST00000376557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.8■■□□□ 1.88
PRR3-201ENST00000376557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PRR3-201ENST00000376557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.69■■□□□ 1.7
PRR3-201ENST00000376557 ABCC9O60706 1549 aa25.66■■□□□ 1.7
PRR3-201ENST00000376557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.34■■□□□ 1.65
PRR3-201ENST00000376557 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.19■■□□□ 1.62
PRR3-201ENST00000376557 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
PRR3-201ENST00000376557 NACADO15069 1562 aa25.04■■□□□ 1.6
PRR3-201ENST00000376557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
PRR3-201ENST00000376557 SCRIBQ14160 1630 aa24.78■■□□□ 1.56
PRR3-201ENST00000376557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.4■■□□□ 1.5
PRR3-201ENST00000376557 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
PRR3-201ENST00000376557 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PRR3-201ENST00000376557 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.15■■□□□ 1.46
PRR3-201ENST00000376557 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.99■■□□□ 1.43
PRR3-201ENST00000376557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PRR3-201ENST00000376557 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.81■■□□□ 1.4
PRR3-201ENST00000376557 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PRR3-201ENST00000376557 SMARCA4P51532 1647 aa23.68■■□□□ 1.38
PRR3-201ENST00000376557 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PRR3-201ENST00000376557 WIZO95785 1651 aa23.62■■□□□ 1.37
PRR3-201ENST00000376557 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRR3-201ENST00000376557 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.34■■□□□ 1.33
PRR3-201ENST00000376557 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.32■■□□□ 1.32
PRR3-201ENST00000376557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PRR3-201ENST00000376557 SMARCA2P51531 1590 aa23.28■■□□□ 1.32
PRR3-201ENST00000376557 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PRR3-201ENST00000376557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.16■■□□□ 1.3
PRR3-201ENST00000376557 NCAPD3P42695 1498 aa23.13■■□□□ 1.29
PRR3-201ENST00000376557 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.12■■□□□ 1.29
PRR3-201ENST00000376557 HMGXB3Q12766 1538 aa23.05■■□□□ 1.28
PRR3-201ENST00000376557 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.99■■□□□ 1.27
PRR3-201ENST00000376557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.82■■□□□ 1.24
PRR3-201ENST00000376557 TRIM41Q8WV44 630 aa22.68■■□□□ 1.22
PRR3-201ENST00000376557 ABCC8Q09428 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
PRR3-201ENST00000376557 CFTRP13569 1480 aa22.59■■□□□ 1.21
PRR3-201ENST00000376557 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.57■■□□□ 1.2
PRR3-201ENST00000376557 NESP48681 1621 aa22.48■■□□□ 1.19
PRR3-201ENST00000376557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
PRR3-201ENST00000376557 PRDM2Q13029 1718 aa22.41■■□□□ 1.18
PRR3-201ENST00000376557 SYNJ1O43426 1573 aa22.36■■□□□ 1.17
PRR3-201ENST00000376557 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PRR3-201ENST00000376557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.35■■□□□ 1.17
PRR3-201ENST00000376557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.33■■□□□ 1.17
PRR3-201ENST00000376557 CUX1P39880 1505 aa22.26■■□□□ 1.15
PRR3-201ENST00000376557 TOP2BQ02880 1626 aa22.24■■□□□ 1.15
PRR3-201ENST00000376557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
PRR3-201ENST00000376557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.14
PRR3-201ENST00000376557 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.2■■□□□ 1.14
PRR3-201ENST00000376557 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.19■■□□□ 1.14
PRR3-201ENST00000376557 SOGA1O94964 1423 aa22.18■■□□□ 1.14
PRR3-201ENST00000376557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.15■■□□□ 1.14
PRR3-201ENST00000376557 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.13■■□□□ 1.13
PRR3-201ENST00000376557 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.12■■□□□ 1.13
PRR3-201ENST00000376557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PRR3-201ENST00000376557 TOPBP1Q92547 1522 aa22.06■■□□□ 1.12
PRR3-201ENST00000376557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.06■■□□□ 1.12
PRR3-201ENST00000376557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.04■■□□□ 1.12
PRR3-201ENST00000376557 ERCC6Q03468 1493 aa22■■□□□ 1.11
PRR3-201ENST00000376557 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.99■■□□□ 1.11
PRR3-201ENST00000376557 EEA1Q15075 1411 aa21.98■■□□□ 1.11
PRR3-201ENST00000376557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PRR3-201ENST00000376557 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.95■■□□□ 1.1
PRR3-201ENST00000376557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.94■■□□□ 1.1
PRR3-201ENST00000376557 CUX2O14529 1486 aa21.9■■□□□ 1.1
PRR3-201ENST00000376557 KIF27Q86VH2 1401 aa21.89■■□□□ 1.09
PRR3-201ENST00000376557 WDR62O43379 1518 aa21.81■■□□□ 1.08
PRR3-201ENST00000376557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.8■■□□□ 1.08
PRR3-201ENST00000376557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRR3-201ENST00000376557 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 IGF1RP08069 1367 aa21.73■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 GOLGA3Q08378 1498 aa21.73■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 KIF21BO75037 1637 aa21.72■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 WDR97A6NE52 1622 aa21.71■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.71■■□□□ 1.07
PRR3-201ENST00000376557 PRXQ9BXM0 1461 aa21.68■■□□□ 1.06
PRR3-201ENST00000376557 IFT140Q96RY7 1462 aa21.65■■□□□ 1.06
PRR3-201ENST00000376557 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.64■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.63■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.63■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 34.6
PRR3-201ENST00000376557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.63■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.58■■□□□ 1.05
PRR3-201ENST00000376557 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PRR3-201ENST00000376557 CEP162Q5TB80 1403 aa21.54■■□□□ 1.04
PRR3-201ENST00000376557 CUL7Q14999 1698 aa21.49■■□□□ 1.03
PRR3-201ENST00000376557 PBRM1Q86U86 1689 aa21.49■■□□□ 1.03
PRR3-201ENST00000376557 GRIN2BQ13224 1484 aa21.48■■□□□ 1.03
PRR3-201ENST00000376557 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PRR3-201ENST00000376557 CLIP1P30622 1438 aa21.41■■□□□ 1.02
PRR3-201ENST00000376557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.38■■□□□ 1.01
PRR3-201ENST00000376557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.38■■□□□ 1.01
PRR3-201ENST00000376557 ADAMTS12P58397 1594 aa21.36■■□□□ 1.01
PRR3-201ENST00000376557 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.34■■□□□ 1.01
PRR3-201ENST00000376557 FBLN2P98095 1184 aa21.31■■□□□ 1
PRR3-201ENST00000376557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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