RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534680.5

C8orf82-205, Transcript of chromosome 8 open reading frame 82, humanhuman

TSL 5

Gene C8orf82, Length 1,637 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82-205ENST00000534680 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.44■■■■■ 6.47
C8orf82-205ENST00000534680 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.84■■■■■ 5.41
C8orf82-205ENST00000534680 ABCC9O60706 1549 aa46.98■■■■■ 5.11
C8orf82-205ENST00000534680 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
C8orf82-205ENST00000534680 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.16■■■■■ 4.98
C8orf82-205ENST00000534680 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.89■■■■■ 4.94
C8orf82-205ENST00000534680 NACADO15069 1562 aa45.76■■■■■ 4.92
C8orf82-205ENST00000534680 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.75■■■■■ 4.91
C8orf82-205ENST00000534680 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.59■■■■■ 4.89
C8orf82-205ENST00000534680 SCRIBQ14160 1630 aa44.68■■■■■ 4.74
C8orf82-205ENST00000534680 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.46■■■■■ 4.71
C8orf82-205ENST00000534680 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.46■■■■■ 4.71
C8orf82-205ENST00000534680 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
C8orf82-205ENST00000534680 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.07■■■■■ 4.65
C8orf82-205ENST00000534680 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.07■■■■■ 4.48
C8orf82-205ENST00000534680 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
C8orf82-205ENST00000534680 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
C8orf82-205ENST00000534680 SMARCA4P51532 1647 aa42.8■■■■■ 4.44
C8orf82-205ENST00000534680 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.72■■■■■ 4.43
C8orf82-205ENST00000534680 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
C8orf82-205ENST00000534680 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.5■■■■■ 4.39
C8orf82-205ENST00000534680 SMARCA2P51531 1590 aa42.38■■■■■ 4.38
C8orf82-205ENST00000534680 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
C8orf82-205ENST00000534680 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.36■■■■■ 4.37
C8orf82-205ENST00000534680 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.35■■■■■ 4.37
C8orf82-205ENST00000534680 WIZO95785 1651 aa42.31■■■■■ 4.36
C8orf82-205ENST00000534680 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.24■■■■■ 4.35
C8orf82-205ENST00000534680 NCAPD3P42695 1498 aa42.2■■■■■ 4.35
C8orf82-205ENST00000534680 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
C8orf82-205ENST00000534680 HMGXB3Q12766 1538 aa42.06■■■■■ 4.32
C8orf82-205ENST00000534680 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
C8orf82-205ENST00000534680 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.46■■■■■ 4.23
C8orf82-205ENST00000534680 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.07■■■■■ 4.17
C8orf82-205ENST00000534680 CFTRP13569 1480 aa40.98■■■■■ 4.15
C8orf82-205ENST00000534680 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.95■■■■■ 4.15
C8orf82-205ENST00000534680 NESP48681 1621 aa40.88■■■■■ 4.14
C8orf82-205ENST00000534680 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.71■■■■■ 4.11
C8orf82-205ENST00000534680 PRDM2Q13029 1718 aa40.69■■■■■ 4.1
C8orf82-205ENST00000534680 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.58■■■■■ 4.09
C8orf82-205ENST00000534680 ERCC6Q03468 1493 aa40.48■■■■■ 4.07
C8orf82-205ENST00000534680 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.45■■■■■ 4.07
C8orf82-205ENST00000534680 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.4■■■■■ 4.06
C8orf82-205ENST00000534680 ABCC8Q09428 1581 aa40.21■■■■■ 4.03
C8orf82-205ENST00000534680 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
C8orf82-205ENST00000534680 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
C8orf82-205ENST00000534680 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.04■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 CUX1P39880 1505 aa40.03■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.02■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 TOPBP1Q92547 1522 aa40.01■■■■■ 4
C8orf82-205ENST00000534680 TRIM41Q8WV44 630 aa40■■■■□ 3.99
C8orf82-205ENST00000534680 WDR62O43379 1518 aa39.98■■■■□ 3.99
C8orf82-205ENST00000534680 SYNJ1O43426 1573 aa39.96■■■■□ 3.99
C8orf82-205ENST00000534680 TOP2BQ02880 1626 aa39.94■■■■□ 3.98
C8orf82-205ENST00000534680 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.9■■■■□ 3.98
C8orf82-205ENST00000534680 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.78■■■■□ 3.96
C8orf82-205ENST00000534680 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
C8orf82-205ENST00000534680 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
C8orf82-205ENST00000534680 CUX2O14529 1486 aa39.65■■■■□ 3.94
C8orf82-205ENST00000534680 IFT140Q96RY7 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
C8orf82-205ENST00000534680 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.56■■■■□ 3.92
C8orf82-205ENST00000534680 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
C8orf82-205ENST00000534680 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.44■■■■□ 3.9
C8orf82-205ENST00000534680 WDR97A6NE52 1622 aa39.32■■■■□ 3.88
C8orf82-205ENST00000534680 KIF27Q86VH2 1401 aa39.31■■■■□ 3.88
C8orf82-205ENST00000534680 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
C8orf82-205ENST00000534680 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
C8orf82-205ENST00000534680 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.2■■■■□ 3.873e-7■■■■■ 36.6
C8orf82-205ENST00000534680 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.19■■■■□ 3.86
C8orf82-205ENST00000534680 EEA1Q15075 1411 aa39.18■■■■□ 3.86
C8orf82-205ENST00000534680 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.15■■■■□ 3.86
C8orf82-205ENST00000534680 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.14■■■■□ 3.86
C8orf82-205ENST00000534680 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.86
C8orf82-205ENST00000534680 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
C8orf82-205ENST00000534680 GRIN2BQ13224 1484 aa39.05■■■■□ 3.84
C8orf82-205ENST00000534680 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.02■■■■□ 3.84
C8orf82-205ENST00000534680 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.99■■■■□ 3.83
C8orf82-205ENST00000534680 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
C8orf82-205ENST00000534680 PBRM1Q86U86 1689 aa38.98■■■■□ 3.83
C8orf82-205ENST00000534680 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.85■■■■□ 3.81
C8orf82-205ENST00000534680 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
C8orf82-205ENST00000534680 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.82■■■■□ 3.81
C8orf82-205ENST00000534680 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
C8orf82-205ENST00000534680 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.77■■■■□ 3.8
C8orf82-205ENST00000534680 ADAMTS12P58397 1594 aa38.72■■■■□ 3.79
C8orf82-205ENST00000534680 PRXQ9BXM0 1461 aa38.71■■■■□ 3.79
C8orf82-205ENST00000534680 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
C8orf82-205ENST00000534680 FBLN2P98095 1184 aa38.68■■■■□ 3.78
C8orf82-205ENST00000534680 SYNJ2O15056 1496 aa38.68■■■■□ 3.78
C8orf82-205ENST00000534680 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.68■■■■□ 3.78
C8orf82-205ENST00000534680 KIF21BO75037 1637 aa38.62■■■■□ 3.77
C8orf82-205ENST00000534680 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.56■■■■□ 3.76
C8orf82-205ENST00000534680 GOLGA3Q08378 1498 aa38.53■■■■□ 3.76
C8orf82-205ENST00000534680 GRIN2AQ12879 1464 aa38.53■■■■□ 3.76
C8orf82-205ENST00000534680 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
C8orf82-205ENST00000534680 CHD1O14646 1710 aa38.46■■■■□ 3.75
C8orf82-205ENST00000534680 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.41■■■■□ 3.74
C8orf82-205ENST00000534680 OSCARQ8IYS5 282 aa38.29■■■■□ 3.72
C8orf82-205ENST00000534680 NUP160Q12769 1436 aa38.29■■■■□ 3.72
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