RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564652.5

TCF25-212, Transcript of transcription factor 25, humanhuman

TSL 3

Gene TCF25, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25-212ENST00000564652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.36■■■■■ 5.49
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TCF25-212ENST00000564652 ABCC9O60706 1549 aa44.27■■■■■ 4.68
TCF25-212ENST00000564652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.21■■■■■ 4.35
TCF25-212ENST00000564652 NACADO15069 1562 aa41.89■■■■■ 4.3
TCF25-212ENST00000564652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.84■■■■■ 4.29
TCF25-212ENST00000564652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.27■■■■■ 4.2
TCF25-212ENST00000564652 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.27■■■■■ 4.2
TCF25-212ENST00000564652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.21■■■■■ 4.19
TCF25-212ENST00000564652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.16■■■■■ 4.18
TCF25-212ENST00000564652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TCF25-212ENST00000564652 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.79■■■■■ 4.12
TCF25-212ENST00000564652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.76■■■■■ 4.12
TCF25-212ENST00000564652 SCRIBQ14160 1630 aa40.43■■■■■ 4.06
TCF25-212ENST00000564652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
TCF25-212ENST00000564652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.97■■■■□ 3.99
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TCF25-212ENST00000564652 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.88■■■■□ 3.97
TCF25-212ENST00000564652 NCAPD3P42695 1498 aa38.6■■■■□ 3.77
TCF25-212ENST00000564652 SMARCA4P51532 1647 aa38.52■■■■□ 3.76
TCF25-212ENST00000564652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.51■■■■□ 3.76
TCF25-212ENST00000564652 SMARCA2P51531 1590 aa38.5■■■■□ 3.75
TCF25-212ENST00000564652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
TCF25-212ENST00000564652 HMGXB3Q12766 1538 aa38.38■■■■□ 3.73
TCF25-212ENST00000564652 ERCC6Q03468 1493 aa38.34■■■■□ 3.73
TCF25-212ENST00000564652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
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TCF25-212ENST00000564652 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.09■■■■□ 3.69
TCF25-212ENST00000564652 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.01■■■■□ 3.67
TCF25-212ENST00000564652 NESP48681 1621 aa37.98■■■■□ 3.67
TCF25-212ENST00000564652 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.96■■■■□ 3.67
TCF25-212ENST00000564652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.81■■■■□ 3.64
TCF25-212ENST00000564652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.63■■■■□ 3.61
TCF25-212ENST00000564652 WIZO95785 1651 aa37.6■■■■□ 3.61
TCF25-212ENST00000564652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
TCF25-212ENST00000564652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.56■■■■□ 3.6
TCF25-212ENST00000564652 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.48■■■■□ 3.59
TCF25-212ENST00000564652 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.26■■■■□ 3.56
TCF25-212ENST00000564652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
TCF25-212ENST00000564652 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.17■■■■□ 3.54
TCF25-212ENST00000564652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
TCF25-212ENST00000564652 WDR62O43379 1518 aa37.12■■■■□ 3.53
TCF25-212ENST00000564652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.08■■■■□ 3.53
TCF25-212ENST00000564652 CFTRP13569 1480 aa37.03■■■■□ 3.52
TCF25-212ENST00000564652 PRDM2Q13029 1718 aa36.78■■■■□ 3.48
TCF25-212ENST00000564652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
TCF25-212ENST00000564652 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.69■■■■□ 3.46
TCF25-212ENST00000564652 TRIM41Q8WV44 630 aa36.5■■■■□ 3.43
TCF25-212ENST00000564652 OSCARQ8IYS5 282 aa36.45■■■■□ 3.43
TCF25-212ENST00000564652 IFT140Q96RY7 1462 aa36.39■■■■□ 3.42
TCF25-212ENST00000564652 ABCC8Q09428 1581 aa36.37■■■■□ 3.41
TCF25-212ENST00000564652 TOPBP1Q92547 1522 aa36.36■■■■□ 3.41
TCF25-212ENST00000564652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.27■■■■□ 3.4
TCF25-212ENST00000564652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TCF25-212ENST00000564652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
TCF25-212ENST00000564652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
TCF25-212ENST00000564652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
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TCF25-212ENST00000564652 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.91■■■■□ 3.34
TCF25-212ENST00000564652 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.91■■■■□ 3.34
TCF25-212ENST00000564652 FBLN2P98095 1184 aa35.88■■■■□ 3.33
TCF25-212ENST00000564652 SOGA1O94964 1423 aa35.87■■■■□ 3.33
TCF25-212ENST00000564652 CHD1O14646 1710 aa35.86■■■■□ 3.33
TCF25-212ENST00000564652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.85■■■■□ 3.33
TCF25-212ENST00000564652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TCF25-212ENST00000564652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.8■■■■□ 3.32
TCF25-212ENST00000564652 ARHGEF11O15085 1522 aa35.8■■■■□ 3.32
TCF25-212ENST00000564652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
TCF25-212ENST00000564652 WDR97A6NE52 1622 aa35.73■■■■□ 3.31
TCF25-212ENST00000564652 CUX1P39880 1505 aa35.73■■■■□ 3.31
TCF25-212ENST00000564652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.64■■■■□ 3.3
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TCF25-212ENST00000564652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
TCF25-212ENST00000564652 GRIN2BQ13224 1484 aa35.56■■■■□ 3.28
TCF25-212ENST00000564652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
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TCF25-212ENST00000564652 PBRM1Q86U86 1689 aa35.45■■■■□ 3.27
TCF25-212ENST00000564652 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.44■■■■□ 3.26
TCF25-212ENST00000564652 SYNJ2O15056 1496 aa35.42■■■■□ 3.26
TCF25-212ENST00000564652 ARAP1Q96P48 1450 aa35.41■■■■□ 3.26
TCF25-212ENST00000564652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.38■■■■□ 3.25
TCF25-212ENST00000564652 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
TCF25-212ENST00000564652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
TCF25-212ENST00000564652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.31■■■■□ 3.24
TCF25-212ENST00000564652 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
TCF25-212ENST00000564652 TOP2BQ02880 1626 aa35.21■■■■□ 3.23
TCF25-212ENST00000564652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.21■■■■□ 3.23
TCF25-212ENST00000564652 GRIN2AQ12879 1464 aa35.09■■■■□ 3.21
TCF25-212ENST00000564652 ADAMTS12P58397 1594 aa35.08■■■■□ 3.21
TCF25-212ENST00000564652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.99■■■■□ 3.19
TCF25-212ENST00000564652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.96■■■■□ 3.19
TCF25-212ENST00000564652 CEP170Q5SW79 1584 aa34.91■■■■□ 3.18
TCF25-212ENST00000564652 NUP160Q12769 1436 aa34.9■■■■□ 3.18
TCF25-212ENST00000564652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.79■■■■□ 3.16
TCF25-212ENST00000564652 SHROOM2Q13796 1616 aa34.74■■■■□ 3.15
TCF25-212ENST00000564652 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
TCF25-212ENST00000564652 JPH4Q96JJ6 628 aa34.61■■■■□ 3.13
TCF25-212ENST00000564652 KIF27Q86VH2 1401 aa34.61■■■■□ 3.13
TCF25-212ENST00000564652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.57■■■■□ 3.12
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