RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487164.5

TCEA2-216, Transcript of transcription elongation factor A2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCEA2, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2-216ENST00000487164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.31■■■■■ 7.25
TCEA2-216ENST00000487164 ABCC9O60706 1549 aa54.13■■■■■ 6.26
TCEA2-216ENST00000487164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.1■■■■■ 6.25
TCEA2-216ENST00000487164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
TCEA2-216ENST00000487164 NACADO15069 1562 aa51.15■■■■■ 5.78
TCEA2-216ENST00000487164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.93■■■■■ 5.74
TCEA2-216ENST00000487164 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.76■■■■■ 5.72
TCEA2-216ENST00000487164 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.42■■■■■ 5.66
TCEA2-216ENST00000487164 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.41■■■■■ 5.66
TCEA2-216ENST00000487164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.37■■■■■ 5.65
TCEA2-216ENST00000487164 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.02■■■■■ 5.6
TCEA2-216ENST00000487164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50■■■■■ 5.59
TCEA2-216ENST00000487164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.8■■■■■ 5.56
TCEA2-216ENST00000487164 SCRIBQ14160 1630 aa49.35■■■■■ 5.49
TCEA2-216ENST00000487164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.29■■■■■ 5.48
TCEA2-216ENST00000487164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.89■■■■■ 5.42
TCEA2-216ENST00000487164 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
TCEA2-216ENST00000487164 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.74■■■■■ 5.39
TCEA2-216ENST00000487164 NCAPD3P42695 1498 aa47.21■■■■■ 5.15
TCEA2-216ENST00000487164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.09■■■■■ 5.13
TCEA2-216ENST00000487164 SMARCA4P51532 1647 aa47.05■■■■■ 5.12
TCEA2-216ENST00000487164 SMARCA2P51531 1590 aa46.94■■■■■ 5.11
TCEA2-216ENST00000487164 HMGXB3Q12766 1538 aa46.87■■■■■ 5.09
TCEA2-216ENST00000487164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
TCEA2-216ENST00000487164 ERCC6Q03468 1493 aa46.71■■■■■ 5.07
TCEA2-216ENST00000487164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
TCEA2-216ENST00000487164 CUX2O14529 1486 aa46.6■■■■■ 5.05
TCEA2-216ENST00000487164 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.57■■■■■ 5.05
TCEA2-216ENST00000487164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.56■■■■■ 5.04
TCEA2-216ENST00000487164 NESP48681 1621 aa46.51■■■■■ 5.04
TCEA2-216ENST00000487164 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.5■■■■■ 5.03
TCEA2-216ENST00000487164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.15■■■■■ 4.98
TCEA2-216ENST00000487164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
TCEA2-216ENST00000487164 WIZO95785 1651 aa45.95■■■■■ 4.95
TCEA2-216ENST00000487164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.91■■■■■ 4.94
TCEA2-216ENST00000487164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.88■■■■■ 4.94
TCEA2-216ENST00000487164 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.79■■■■■ 4.92
TCEA2-216ENST00000487164 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
TCEA2-216ENST00000487164 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.5■■■■■ 4.87
TCEA2-216ENST00000487164 WDR62O43379 1518 aa45.39■■■■■ 4.86
TCEA2-216ENST00000487164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
TCEA2-216ENST00000487164 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.33■■■■■ 4.85
TCEA2-216ENST00000487164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.29■■■■■ 4.84
TCEA2-216ENST00000487164 CFTRP13569 1480 aa45.27■■■■■ 4.84
TCEA2-216ENST00000487164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
TCEA2-216ENST00000487164 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.85■■■■■ 4.77
TCEA2-216ENST00000487164 PRDM2Q13029 1718 aa44.84■■■■■ 4.77
TCEA2-216ENST00000487164 TRIM41Q8WV44 630 aa44.57■■■■■ 4.73
TCEA2-216ENST00000487164 OSCARQ8IYS5 282 aa44.48■■■■■ 4.71
TCEA2-216ENST00000487164 TOPBP1Q92547 1522 aa44.44■■■■■ 4.7
TCEA2-216ENST00000487164 IFT140Q96RY7 1462 aa44.41■■■■■ 4.7
TCEA2-216ENST00000487164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
TCEA2-216ENST00000487164 ABCC8Q09428 1581 aa44.3■■■■■ 4.68
TCEA2-216ENST00000487164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.26■■■■■ 4.68
TCEA2-216ENST00000487164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
TCEA2-216ENST00000487164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
TCEA2-216ENST00000487164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
TCEA2-216ENST00000487164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.96■■■■■ 4.63
TCEA2-216ENST00000487164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.93■■■■■ 4.62
TCEA2-216ENST00000487164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.93■■■■■ 4.62
TCEA2-216ENST00000487164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.93■■■■■ 4.62
TCEA2-216ENST00000487164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.83■■■■■ 4.61
TCEA2-216ENST00000487164 CHD1O14646 1710 aa43.8■■■■■ 4.6
TCEA2-216ENST00000487164 ARHGEF11O15085 1522 aa43.79■■■■■ 4.6
TCEA2-216ENST00000487164 SOGA1O94964 1423 aa43.77■■■■■ 4.6
TCEA2-216ENST00000487164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
TCEA2-216ENST00000487164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.59
TCEA2-216ENST00000487164 CUX1P39880 1505 aa43.69■■■■■ 4.59
TCEA2-216ENST00000487164 FBLN2P98095 1184 aa43.67■■■■■ 4.58
TCEA2-216ENST00000487164 WDR97A6NE52 1622 aa43.55■■■■■ 4.56
TCEA2-216ENST00000487164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
TCEA2-216ENST00000487164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.52■■■■■ 4.56
TCEA2-216ENST00000487164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.47■■■■■ 4.55
TCEA2-216ENST00000487164 GRIN2BQ13224 1484 aa43.38■■■■■ 4.54
TCEA2-216ENST00000487164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.54
TCEA2-216ENST00000487164 ARAP1Q96P48 1450 aa43.37■■■■■ 4.53
TCEA2-216ENST00000487164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
TCEA2-216ENST00000487164 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.28■■■■■ 4.52
TCEA2-216ENST00000487164 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.25■■■■■ 4.51
TCEA2-216ENST00000487164 SYNJ1O43426 1573 aa43.24■■■■■ 4.51
TCEA2-216ENST00000487164 PBRM1Q86U86 1689 aa43.24■■■■■ 4.51
TCEA2-216ENST00000487164 SYNJ2O15056 1496 aa43.24■■■■■ 4.51
TCEA2-216ENST00000487164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.21■■■■■ 4.51
TCEA2-216ENST00000487164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.15■■■■■ 4.5
TCEA2-216ENST00000487164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.03■■■■■ 4.48
TCEA2-216ENST00000487164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.98■■■■■ 4.47
TCEA2-216ENST00000487164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
TCEA2-216ENST00000487164 TOP2BQ02880 1626 aa42.97■■■■■ 4.47
TCEA2-216ENST00000487164 GRIN2AQ12879 1464 aa42.84■■■■■ 4.45
TCEA2-216ENST00000487164 ADAMTS12P58397 1594 aa42.83■■■■■ 4.45
TCEA2-216ENST00000487164 CEP170Q5SW79 1584 aa42.7■■■■■ 4.43
TCEA2-216ENST00000487164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.69■■■■■ 4.42
TCEA2-216ENST00000487164 NUP160Q12769 1436 aa42.69■■■■■ 4.42
TCEA2-216ENST00000487164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
TCEA2-216ENST00000487164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.65■■■■■ 4.42
TCEA2-216ENST00000487164 SHROOM2Q13796 1616 aa42.5■■■■■ 4.39
TCEA2-216ENST00000487164 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
TCEA2-216ENST00000487164 JPH4Q96JJ6 628 aa42.25■■■■■ 4.35
TCEA2-216ENST00000487164 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.22■■■■■ 4.35
TCEA2-216ENST00000487164 KIF27Q86VH2 1401 aa42.13■■■■■ 4.34
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