Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA5O15230 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA5O15230 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA5O15230 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA5O15230 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms