Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYSRT1A8MQ03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYSRT1A8MQ03 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms