RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404488.7

CRELD2-203, Transcript of cysteine rich with EGF like domains 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRELD2, Length 1,577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD2-203ENST00000404488 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.18■■■■■ 7.22
CRELD2-203ENST00000404488 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.2■■■■■ 6.11
CRELD2-203ENST00000404488 ABCC9O60706 1549 aa51.85■■■■■ 5.89
CRELD2-203ENST00000404488 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.28■■■■■ 5.64
CRELD2-203ENST00000404488 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.18■■■■■ 5.62
CRELD2-203ENST00000404488 NACADO15069 1562 aa50.01■■■■■ 5.6
CRELD2-203ENST00000404488 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.96■■■■■ 5.59
CRELD2-203ENST00000404488 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.83■■■■■ 5.57
CRELD2-203ENST00000404488 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.76■■■■■ 5.56
CRELD2-203ENST00000404488 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.79■■■■■ 5.4
CRELD2-203ENST00000404488 SCRIBQ14160 1630 aa48.67■■■■■ 5.38
CRELD2-203ENST00000404488 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.62■■■■■ 5.37
CRELD2-203ENST00000404488 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.48■■■■■ 5.35
CRELD2-203ENST00000404488 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.91■■■■■ 5.26
CRELD2-203ENST00000404488 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.37■■■■■ 5.17
CRELD2-203ENST00000404488 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
CRELD2-203ENST00000404488 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.9■■■■■ 5.1
CRELD2-203ENST00000404488 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.87■■■■■ 5.09
CRELD2-203ENST00000404488 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
CRELD2-203ENST00000404488 SMARCA4P51532 1647 aa46.57■■■■■ 5.05
CRELD2-203ENST00000404488 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.42■■■■■ 5.02
CRELD2-203ENST00000404488 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.28■■■■■ 5
CRELD2-203ENST00000404488 NCAPD3P42695 1498 aa46.21■■■■■ 4.99
CRELD2-203ENST00000404488 SMARCA2P51531 1590 aa46.18■■■■■ 4.98
CRELD2-203ENST00000404488 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.1■■■■■ 4.97
CRELD2-203ENST00000404488 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
CRELD2-203ENST00000404488 HMGXB3Q12766 1538 aa45.92■■■■■ 4.94
CRELD2-203ENST00000404488 WIZO95785 1651 aa45.9■■■■■ 4.94
CRELD2-203ENST00000404488 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
CRELD2-203ENST00000404488 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
CRELD2-203ENST00000404488 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
CRELD2-203ENST00000404488 NESP48681 1621 aa45■■■■■ 4.79
CRELD2-203ENST00000404488 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.95■■■■■ 4.79
CRELD2-203ENST00000404488 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.9■■■■■ 4.78
CRELD2-203ENST00000404488 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.84■■■■■ 4.77
CRELD2-203ENST00000404488 CFTRP13569 1480 aa44.69■■■■■ 4.74
CRELD2-203ENST00000404488 ERCC6Q03468 1493 aa44.62■■■■■ 4.73
CRELD2-203ENST00000404488 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.6■■■■■ 4.73
CRELD2-203ENST00000404488 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.37■■■■■ 4.69
CRELD2-203ENST00000404488 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.35■■■■■ 4.69
CRELD2-203ENST00000404488 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.22■■■■■ 4.67
CRELD2-203ENST00000404488 PRDM2Q13029 1718 aa44.21■■■■■ 4.67
CRELD2-203ENST00000404488 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CRELD2-203ENST00000404488 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.08■■■■■ 4.65
CRELD2-203ENST00000404488 CUX2O14529 1486 aa43.98■■■■■ 4.63
CRELD2-203ENST00000404488 WDR62O43379 1518 aa43.91■■■■■ 4.62
CRELD2-203ENST00000404488 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
CRELD2-203ENST00000404488 TOPBP1Q92547 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
CRELD2-203ENST00000404488 ABCC8Q09428 1581 aa43.67■■■■■ 4.58
CRELD2-203ENST00000404488 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.61■■■■■ 4.57
CRELD2-203ENST00000404488 CUX1P39880 1505 aa43.5■■■■■ 4.55
CRELD2-203ENST00000404488 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
CRELD2-203ENST00000404488 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
CRELD2-203ENST00000404488 IFT140Q96RY7 1462 aa43.29■■■■■ 4.52
CRELD2-203ENST00000404488 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.29■■■■■ 4.52
CRELD2-203ENST00000404488 SOGA1O94964 1423 aa43.22■■■■■ 4.51
CRELD2-203ENST00000404488 SYNJ1O43426 1573 aa43.22■■■■■ 4.51
CRELD2-203ENST00000404488 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.2■■■■■ 4.51
CRELD2-203ENST00000404488 TOP2BQ02880 1626 aa43.19■■■■■ 4.5
CRELD2-203ENST00000404488 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
CRELD2-203ENST00000404488 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.15■■■■■ 4.5
CRELD2-203ENST00000404488 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CRELD2-203ENST00000404488 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CRELD2-203ENST00000404488 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.478e-7■■■■■ 28.7
CRELD2-203ENST00000404488 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.88■■■■■ 4.45
CRELD2-203ENST00000404488 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
CRELD2-203ENST00000404488 WDR97A6NE52 1622 aa42.82■■■■■ 4.44
CRELD2-203ENST00000404488 TRIM41Q8WV44 630 aa42.7■■■■■ 4.43
CRELD2-203ENST00000404488 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.69■■■■■ 4.42
CRELD2-203ENST00000404488 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.63■■■■■ 4.41
CRELD2-203ENST00000404488 GRIN2BQ13224 1484 aa42.61■■■■■ 4.41
CRELD2-203ENST00000404488 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.5■■■■■ 4.39
CRELD2-203ENST00000404488 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.47■■■■■ 4.39
CRELD2-203ENST00000404488 PBRM1Q86U86 1689 aa42.46■■■■■ 4.39
CRELD2-203ENST00000404488 KIF27Q86VH2 1401 aa42.44■■■■■ 4.38
CRELD2-203ENST00000404488 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
CRELD2-203ENST00000404488 FBLN2P98095 1184 aa42.4■■■■■ 4.38
CRELD2-203ENST00000404488 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
CRELD2-203ENST00000404488 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.35■■■■■ 4.37
CRELD2-203ENST00000404488 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
CRELD2-203ENST00000404488 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.31■■■■■ 4.36
CRELD2-203ENST00000404488 IGF1RP08069 1367 aa42.29■■■■■ 4.36
CRELD2-203ENST00000404488 SYNJ2O15056 1496 aa42.29■■■■■ 4.36
CRELD2-203ENST00000404488 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
CRELD2-203ENST00000404488 CHD1O14646 1710 aa42.24■■■■■ 4.35
CRELD2-203ENST00000404488 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.21■■■■■ 4.35
CRELD2-203ENST00000404488 ADAMTS12P58397 1594 aa42.18■■■■■ 4.34
CRELD2-203ENST00000404488 GRIN2AQ12879 1464 aa42.06■■■■■ 4.32
CRELD2-203ENST00000404488 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.02■■■■■ 4.32
CRELD2-203ENST00000404488 CUL7Q14999 1698 aa41.99■■■■■ 4.31
CRELD2-203ENST00000404488 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.87■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 NUP160Q12769 1436 aa41.87■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 EEA1Q15075 1411 aa41.85■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.83■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 CEP170Q5SW79 1584 aa41.82■■■■■ 4.29
CRELD2-203ENST00000404488 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.77■■■■■ 4.28
CRELD2-203ENST00000404488 PRXQ9BXM0 1461 aa41.73■■■■■ 4.27
CRELD2-203ENST00000404488 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.58■■■■■ 4.25
CRELD2-203ENST00000404488 ARHGEF11O15085 1522 aa41.57■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms