Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
XIRP2A4UGR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XIRP2A4UGR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
XIRP2A4UGR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XIRP2A4UGR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms