Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.74e-10■■□□□ 12.5
FMR1Q06787 GSR-203ENST00000523295 913 ntTSL 318.55■□□□□ 0.564e-10■■□□□ 12.5
FMR1Q06787 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.683e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.473e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IWS1-202ENST00000409725 1080 ntTSL 216.79■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.166e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 VIRMA-207ENST00000522263 3219 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.216e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IWS1-210ENST00000495369 811 ntTSL 26.14□□□□□ -1.434e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.66e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 513.74□□□□□ -0.214e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.233e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.333e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 JUP-210ENST00000585793 598 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 219.51■□□□□ 0.711e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.352e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.32e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.182e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 325.69■■□□□ 1.72e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 223.54■■□□□ 1.362e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.452e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -02e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KDM5B-207ENST00000472822 1648 ntTSL 1 (best)10.66□□□□□ -0.73e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 235.21■■■■□ 3.237e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.477e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.517e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PWP1-204ENST00000547995 569 ntTSL 422.22■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PWP1-205ENST00000552760 851 ntTSL 214.94□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 RPA1-202ENST00000570451 630 ntTSL 326.99■■□□□ 1.913e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 RPA1-203ENST00000571058 577 ntTSL 421.67■■□□□ 1.063e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 520.94■□□□□ 0.943e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-7■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 DHX30-212ENST00000474183 963 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 PRKAR1A-210ENST00000585981 995 ntTSL 59.49□□□□□ -0.893e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CORO7-232ENST00000576637 730 ntTSL 320.2■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 534.77■■■■□ 3.164e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 231.31■■■□□ 2.64e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.54e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 330.16■■■□□ 2.424e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 229.85■■■□□ 2.374e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 329.85■■■□□ 2.374e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CHAF1A-205ENST00000587580 494 ntTSL 329.3■■■□□ 2.284e-11■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 YWHAH-204ENST00000443669 822 ntTSL 328.85■■■□□ 2.214e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 528.74■■■□□ 2.194e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)27.79■■■□□ 2.044e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.984e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.874e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CHAF1A-203ENST00000585854 499 ntTSL 226.54■■□□□ 1.844e-11■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KTN1-221ENST00000555498 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.87■■□□□ 1.734e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.734e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.684e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.644e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.384e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.324e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 YWHAH-205ENST00000471374 1735 ntTSL 222.41■■□□□ 1.184e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.174e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 522.06■■□□□ 1.124e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.034e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 320.23■□□□□ 0.834e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GATAD2B-202ENST00000634401 867 ntTSL 520.19■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 419.52■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 418.9■□□□□ 0.621e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 DNMT1-217ENST00000589091 563 ntTSL 318.63■□□□□ 0.571e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 418.46■□□□□ 0.551e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 417.61■□□□□ 0.411e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GATAD2B-210ENST00000637331 145 ntTSL 517.5■□□□□ 0.394e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 317.14■□□□□ 0.331e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 EDC4-209ENST00000575033 530 ntTSL 316.43■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 N4BP1-202ENST00000564124 2485 ntTSL 515.21■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 LZTR1-203ENST00000415354 648 ntTSL 315.07■□□□□ 05e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 YWHAH-206ENST00000479649 662 ntTSL 314.44□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 414.09□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 TBC1D9B-205ENST00000518115 548 ntTSL 513.9□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 12.4
FMR1Q06787 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 312.64□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 12.4
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