Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 UXS1-213ENST00000479774 590 ntTSL 46.74□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 56.64□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 FAM13A-211ENST00000508360 1030 ntTSL 36.35□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-208ENST00000537600 516 ntTSL 46.35□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 FBXO38-208ENST00000504971 492 ntTSL 36.25□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DTYMK-204ENST00000432348 926 ntTSL 56.14□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SNX10-205ENST00000412416 429 ntTSL 35.69□□□□□ -1.59e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 GNL3-211ENST00000496254 2118 ntTSL 55.6□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 GNL3-206ENST00000468885 263 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.522e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-223ENST00000557076 743 ntTSL 34.48□□□□□ -1.692e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DEK-205ENST00000507591 739 ntTSL 23.94□□□□□ -1.782e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-205ENST00000469043 696 ntTSL 23.91□□□□□ -1.782e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 53.87□□□□□ -1.792e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 FAM13A-208ENST00000506433 571 ntTSL 43.83□□□□□ -1.82e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 23.42□□□□□ -1.862e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 43.13□□□□□ -1.912e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.972e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-221ENST00000556534 864 ntTSL 52.7□□□□□ -1.982e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 22.53□□□□□ -23e-7■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-210ENST00000553693 490 ntTSL 32.28□□□□□ -2.042e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 SCFD1-213ENST00000554776 583 ntTSL 52.24□□□□□ -2.052e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 AC007388.1-211ENST00000451547 329 ntTSL 51.83□□□□□ -2.122e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 DYRK1A-208ENST00000498351 224 ntTSL 1 (best)-1.83□□□□□ -2.72e-9■■■■■ 43.2
TBRG4Q969Z0 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.36□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 43.1
TBRG4Q969Z0 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 517.91■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 43.1
TBRG4Q969Z0 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 324.42■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 43
TBRG4Q969Z0 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 524.42■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 43
TBRG4Q969Z0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 43
TBRG4Q969Z0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 43
TBRG4Q969Z0 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 43
TBRG4Q969Z0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 02e-7■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 42.8
TBRG4Q969Z0 ZNF362-203ENST00000483388 712 ntTSL 222.58■■□□□ 1.217e-11■■■■■ 42.7
TBRG4Q969Z0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 42.7
TBRG4Q969Z0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 42.7
TBRG4Q969Z0 ZNF362-204ENST00000490959 197 ntTSL 59.11□□□□□ -0.957e-11■■■■■ 42.7
TBRG4Q969Z0 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 510.93□□□□□ -0.663e-16■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 414.53□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 42.6
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TBRG4Q969Z0 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 42.6
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TBRG4Q969Z0 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 322.36■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 213.26□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 42.6
TBRG4Q969Z0 CDS2-206ENST00000486875 709 ntTSL 212□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 42.6
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TBRG4Q969Z0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-10■■■■■ 42.5
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TBRG4Q969Z0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-211ENST00000529517 514 ntTSL 417.05■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 315.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 214.08□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-208ENST00000496046 2089 ntTSL 512.62□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-204ENST00000395491 2401 ntTSL 212.38□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 ARF4-207ENST00000493378 548 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 29.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 MAP2K3-209ENST00000526076 575 ntTSL 49.26□□□□□ -0.931e-10■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 RERE-217ENST00000507012 418 ntTSL 510.79□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 42.5
TBRG4Q969Z0 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 42.4
TBRG4Q969Z0 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.82□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 SMAD3-206ENST00000558739 586 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 410.28□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 59.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 59.64□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 RERE-207ENST00000464972 743 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 42.3
TBRG4Q969Z0 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)23.35■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 42.2
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