RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467923.5

CDS2-204, Transcript of CDP-diacylglycerol synthase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CDS2, Length 783 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS2-204ENST00000467923 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.38■■■■■ 7.1
CDS2-204ENST00000467923 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.17■■■■■ 6.1
CDS2-204ENST00000467923 ABCC9O60706 1549 aa53.14■■■■■ 6.1
CDS2-204ENST00000467923 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.64■■■■■ 5.7
CDS2-204ENST00000467923 NACADO15069 1562 aa50.34■■■■■ 5.65
CDS2-204ENST00000467923 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.19■■■■■ 5.63
CDS2-204ENST00000467923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.9■■■■■ 5.58
CDS2-204ENST00000467923 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.72■■■■■ 5.55
CDS2-204ENST00000467923 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.57■■■■■ 5.53
CDS2-204ENST00000467923 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.35■■■■■ 5.49
CDS2-204ENST00000467923 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
CDS2-204ENST00000467923 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
CDS2-204ENST00000467923 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.09■■■■■ 5.45
CDS2-204ENST00000467923 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.55■■■■■ 5.36
CDS2-204ENST00000467923 SCRIBQ14160 1630 aa48.41■■■■■ 5.34
CDS2-204ENST00000467923 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.99■■■■■ 5.27
CDS2-204ENST00000467923 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
CDS2-204ENST00000467923 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.91■■■■■ 5.26
CDS2-204ENST00000467923 NCAPD3P42695 1498 aa46.53■■■■■ 5.04
CDS2-204ENST00000467923 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.35■■■■■ 5.01
CDS2-204ENST00000467923 SMARCA4P51532 1647 aa46.24■■■■■ 4.99
CDS2-204ENST00000467923 SMARCA2P51531 1590 aa46.2■■■■■ 4.99
CDS2-204ENST00000467923 HMGXB3Q12766 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
CDS2-204ENST00000467923 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CDS2-204ENST00000467923 ERCC6Q03468 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
CDS2-204ENST00000467923 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.84■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.84■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 CUX2O14529 1486 aa45.83■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.71■■■■■ 4.91
CDS2-204ENST00000467923 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
CDS2-204ENST00000467923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.39■■■■■ 4.86
CDS2-204ENST00000467923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.21■■■■■ 4.83
CDS2-204ENST00000467923 WIZO95785 1651 aa45.13■■■■■ 4.82
CDS2-204ENST00000467923 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.13■■■■■ 4.82
CDS2-204ENST00000467923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
CDS2-204ENST00000467923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
CDS2-204ENST00000467923 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
CDS2-204ENST00000467923 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.72■■■■■ 4.75
CDS2-204ENST00000467923 WDR62O43379 1518 aa44.6■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 CFTRP13569 1480 aa44.59■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.56■■■■■ 4.72
CDS2-204ENST00000467923 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
CDS2-204ENST00000467923 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.15■■■■■ 4.66
CDS2-204ENST00000467923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
CDS2-204ENST00000467923 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
CDS2-204ENST00000467923 OSCARQ8IYS5 282 aa43.88■■■■■ 4.62
CDS2-204ENST00000467923 TRIM41Q8WV44 630 aa43.77■■■■■ 4.6
CDS2-204ENST00000467923 IFT140Q96RY7 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
CDS2-204ENST00000467923 ABCC8Q09428 1581 aa43.7■■■■■ 4.59
CDS2-204ENST00000467923 TOPBP1Q92547 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
CDS2-204ENST00000467923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
CDS2-204ENST00000467923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.51■■■■■ 4.56
CDS2-204ENST00000467923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
CDS2-204ENST00000467923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
CDS2-204ENST00000467923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.25■■■■■ 4.512e-8■■■■■ 37.6
CDS2-204ENST00000467923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
CDS2-204ENST00000467923 SOGA1O94964 1423 aa43.14■■■■■ 4.5
CDS2-204ENST00000467923 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.09■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
CDS2-204ENST00000467923 FBLN2P98095 1184 aa43■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 ARHGEF11O15085 1522 aa42.99■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.97■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 CUX1P39880 1505 aa42.93■■■■■ 4.46
CDS2-204ENST00000467923 CHD1O14646 1710 aa42.91■■■■■ 4.46
CDS2-204ENST00000467923 WDR97A6NE52 1622 aa42.87■■■■■ 4.45
CDS2-204ENST00000467923 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.8■■■■■ 4.44
CDS2-204ENST00000467923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.75■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 GRIN2BQ13224 1484 aa42.71■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
CDS2-204ENST00000467923 ARAP1Q96P48 1450 aa42.57■■■■■ 4.41
CDS2-204ENST00000467923 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.56■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 SYNJ2O15056 1496 aa42.55■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.53■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.51■■■■■ 4.39
CDS2-204ENST00000467923 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.38
CDS2-204ENST00000467923 PBRM1Q86U86 1689 aa42.4■■■■■ 4.38
CDS2-204ENST00000467923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.37■■■■■ 4.37
CDS2-204ENST00000467923 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
CDS2-204ENST00000467923 TOP2BQ02880 1626 aa42.28■■■■■ 4.36
CDS2-204ENST00000467923 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.24■■■■■ 4.35
CDS2-204ENST00000467923 GRIN2AQ12879 1464 aa42.12■■■■■ 4.33
CDS2-204ENST00000467923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.05■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 NUP160Q12769 1436 aa42.01■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42■■■■■ 4.31
CDS2-204ENST00000467923 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
CDS2-204ENST00000467923 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.82■■■■■ 4.29
CDS2-204ENST00000467923 SHROOM2Q13796 1616 aa41.75■■■■■ 4.27
CDS2-204ENST00000467923 JPH4Q96JJ6 628 aa41.7■■■■■ 4.27
CDS2-204ENST00000467923 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CDS2-204ENST00000467923 IGF1RP08069 1367 aa41.56■■■■■ 4.24
CDS2-204ENST00000467923 KIF27Q86VH2 1401 aa41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms