Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB15P59190 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB15P59190 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB15P59190 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB15P59190 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB15P59190 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms