Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RAB15P59190 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB15P59190 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RAB15P59190 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB15P59190 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RAB15P59190 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RAB15P59190 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RAB15P59190 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RAB15P59190 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAB15P59190 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RAB15P59190 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAB15P59190 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB15P59190 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB15P59190 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB15P59190 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB15P59190 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB15P59190 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB15P59190 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAB15P59190 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAB15P59190 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAB15P59190 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RAB15P59190 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RAB15P59190 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAB15P59190 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAB15P59190 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAB15P59190 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAB15P59190 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAB15P59190 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB15P59190 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB15P59190 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RAB15P59190 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB15P59190 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB15P59190 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB15P59190 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB15P59190 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB15P59190 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB15P59190 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB15P59190 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB15P59190 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB15P59190 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB15P59190 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB15P59190 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB15P59190 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB15P59190 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB15P59190 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB15P59190 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB15P59190 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB15P59190 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAB15P59190 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB15P59190 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB15P59190 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB15P59190 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB15P59190 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB15P59190 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB15P59190 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB15P59190 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB15P59190 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB15P59190 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB15P59190 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB15P59190 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB15P59190 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB15P59190 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB15P59190 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB15P59190 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB15P59190 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB15P59190 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB15P59190 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB15P59190 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB15P59190 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB15P59190 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB15P59190 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB15P59190 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB15P59190 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB15P59190 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB15P59190 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB15P59190 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB15P59190 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB15P59190 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB15P59190 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB15P59190 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB15P59190 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB15P59190 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB15P59190 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB15P59190 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB15P59190 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB15P59190 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB15P59190 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB15P59190 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB15P59190 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB15P59190 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB15P59190 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB15P59190 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB15P59190 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAB15P59190 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB15P59190 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB15P59190 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB15P59190 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB15P59190 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB15P59190 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB15P59190 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms