RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335478.4

ANKRD18DP-201, Transcript of ankyrin repeat domain 18D, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD18DP, Length 2,171 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.08■■■■■ 4.17
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.65■■■■□ 3.3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ABCC9O60706 1549 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.8■■■■□ 3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.71■■■□□ 2.99
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.45■■■□□ 2.95
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NACADO15069 1562 aa33.13■■■□□ 2.89
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SCRIBQ14160 1630 aa32.82■■■□□ 2.84
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.76■■■□□ 2.83
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
ANKRD18DP-201ENST00000335478 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.17■■■□□ 2.74
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
ANKRD18DP-201ENST00000335478 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.81■■■□□ 2.68
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.76■■■□□ 2.67
ANKRD18DP-201ENST00000335478 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
ANKRD18DP-201ENST00000335478 WIZO95785 1651 aa31.52■■■□□ 2.64
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SMARCA4P51532 1647 aa31.5■■■□□ 2.63
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.44■■■□□ 2.62
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.12■■■□□ 2.57
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SMARCA2P51531 1590 aa30.91■■■□□ 2.54
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.91■■■□□ 2.54
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.89■■■□□ 2.54
ANKRD18DP-201ENST00000335478 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TRIM41Q8WV44 630 aa30.65■■■□□ 2.5
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.65■■■□□ 2.5
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.64■■■□□ 2.5
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NCAPD3P42695 1498 aa30.6■■■□□ 2.49
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HMGXB3Q12766 1538 aa30.55■■■□□ 2.48
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ABCC8Q09428 1581 aa30.33■■■□□ 2.45
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.26■■■□□ 2.43
ANKRD18DP-201ENST00000335478 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.41
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CFTRP13569 1480 aa30.01■■■□□ 2.39
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SYNJ1O43426 1573 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PRDM2Q13029 1718 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SOGA1O94964 1423 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EEA1Q15075 1411 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TOP2BQ02880 1626 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HRCP23327 699 aa29.82■■■□□ 2.36
ANKRD18DP-201ENST00000335478 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.79■■■□□ 2.36
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.73■■■□□ 2.35
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.67■■■□□ 2.34
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CUX1P39880 1505 aa29.67■■■□□ 2.34
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.63■■■□□ 2.33
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NESP48681 1621 aa29.55■■■□□ 2.32
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KIF21BO75037 1637 aa29.44■■■□□ 2.3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.43■■■□□ 2.3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GOLGA3Q08378 1498 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.4■■■□□ 2.3
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KIF27Q86VH2 1401 aa29.3■■■□□ 2.28
ANKRD18DP-201ENST00000335478 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.28■■■□□ 2.28
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CEP162Q5TB80 1403 aa29.27■■■□□ 2.28
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TOPBP1Q92547 1522 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PRXQ9BXM0 1461 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.16■■■□□ 2.26
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CUX2O14529 1486 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ERCC6Q03468 1493 aa29.14■■■□□ 2.25
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ANKRD18DP-201ENST00000335478 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ANKRD18DP-201ENST00000335478 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ANKRD18DP-201ENST00000335478 IGF1RP08069 1367 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CLIP1P30622 1438 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD18DP-201ENST00000335478 WDR97A6NE52 1622 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD18DP-201ENST00000335478 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD18DP-201ENST00000335478 WDR62O43379 1518 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD18DP-201ENST00000335478 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CUL7Q14999 1698 aa28.75■■■□□ 2.19
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ARAP1Q96P48 1450 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD18DP-201ENST00000335478 IFT140Q96RY7 1462 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PBRM1Q86U86 1689 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.49■■■□□ 2.15
ANKRD18DP-201ENST00000335478 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
ANKRD18DP-201ENST00000335478 APLP2Q06481 763 aa28.47■■■□□ 2.15
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