Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHORDC1Q9UHD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHORDC1Q9UHD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHORDC1Q9UHD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms