Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 CHTF18-214ENST00000563545 569 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-8■■■□□ 16.1
NOL12Q9UGY1 CHTF18-219ENST00000570058 471 ntTSL 219.62■□□□□ 0.732e-8■■■□□ 16.1
NOL12Q9UGY1 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 219.13■□□□□ 0.652e-8■■■□□ 16.1
NOL12Q9UGY1 E4F1-203ENST00000563643 793 ntTSL 316.65■□□□□ 0.262e-8■■■□□ 16.1
NOL12Q9UGY1 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 215.05■□□□□ -02e-8■■■□□ 16.1
NOL12Q9UGY1 NEU4-211ENST00000435855 2281 ntTSL 224.92■■□□□ 1.584e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-208ENST00000465429 1454 ntTSL 224.2■■□□□ 1.474e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.44e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ADRM1-202ENST00000462554 735 ntTSL 323.69■■□□□ 1.384e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.354e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.294e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.284e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.064e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 NEU4-217ENST00000618597 3013 ntTSL 221.66■■□□□ 1.064e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 14e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 320.86■□□□□ 0.931e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 UBA1-206ENST00000442035 1054 ntTSL 519.16■□□□□ 0.661e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.631e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 517.83■□□□□ 0.444e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 317.22■□□□□ 0.354e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 LMNA-217ENST00000498722 1348 ntTSL 216.75■□□□□ 0.271e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.264e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.011e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 UBA1-204ENST00000412206 1148 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ADRM1-203ENST00000465805 630 ntTSL 213.81□□□□□ -0.24e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 213.67□□□□□ -0.221e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-217ENST00000524534 2441 ntTSL 513.4□□□□□ -0.261e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 512.73□□□□□ -0.374e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.444e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)10.61□□□□□ -0.711e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 210.22□□□□□ -0.771e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 39.63□□□□□ -0.871e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.911e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 38.42□□□□□ -1.061e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-213ENST00000490332 612 ntTSL 55.55□□□□□ -1.521e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-215ENST00000498284 524 ntTSL 54.93□□□□□ -1.621e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PTPRK-202ENST00000368205 662 ntTSL 23.66□□□□□ -1.821e-8■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 ACADVL-231ENST00000582450 294 ntTSL 214.28□□□□□ -0.121e-17■■■□□ 16
NOL12Q9UGY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.427e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.37e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)22.73■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.927e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 215.99■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.041e-6■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.296e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.136e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 OBSL1-208ENST00000465149 5380 ntTSL 221.91■■□□□ 1.16e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.976e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.46e-7■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-8■■■□□ 15.9
NOL12Q9UGY1 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 217.1■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.433e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-6■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 310.13□□□□□ -0.791e-9■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.145e-24■■■□□ 15.8
NOL12Q9UGY1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-216ENST00000489707 1935 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.352e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.242e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 215.84■□□□□ 0.132e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-9■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.132e-6■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 225.9■■□□□ 1.742e-6■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.622e-6■■■□□ 15.7
NOL12Q9UGY1 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 224.97■■□□□ 1.592e-6■■■□□ 15.7
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 109.6 ms