RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.59■■■■■ 6.49
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.85■■■■■ 5.57
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC9O60706 1549 aa49.69■■■■■ 5.54
CHTF18-214ENST00000563545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.37■■■■■ 5.17
CHTF18-214ENST00000563545 NACADO15069 1562 aa47.07■■■■■ 5.12
CHTF18-214ENST00000563545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.86■■■■■ 5.09
CHTF18-214ENST00000563545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.47■■■■■ 5.03
CHTF18-214ENST00000563545 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
CHTF18-214ENST00000563545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.36■■■■■ 5.01
CHTF18-214ENST00000563545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
CHTF18-214ENST00000563545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
CHTF18-214ENST00000563545 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.98■■■■■ 4.95
CHTF18-214ENST00000563545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.92■■■■■ 4.94
CHTF18-214ENST00000563545 SCRIBQ14160 1630 aa45.43■■■■■ 4.86
CHTF18-214ENST00000563545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
CHTF18-214ENST00000563545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.9■■■■■ 4.78
CHTF18-214ENST00000563545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
CHTF18-214ENST00000563545 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.74■■■■■ 4.75
CHTF18-214ENST00000563545 NCAPD3P42695 1498 aa43.43■■■■■ 4.54
CHTF18-214ENST00000563545 SMARCA4P51532 1647 aa43.35■■■■■ 4.53
CHTF18-214ENST00000563545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.33■■■■■ 4.53
CHTF18-214ENST00000563545 SMARCA2P51531 1590 aa43.23■■■■■ 4.51
CHTF18-214ENST00000563545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
CHTF18-214ENST00000563545 HMGXB3Q12766 1538 aa43.14■■■■■ 4.5
CHTF18-214ENST00000563545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
CHTF18-214ENST00000563545 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.91■■■■■ 4.46
CHTF18-214ENST00000563545 ERCC6Q03468 1493 aa42.88■■■■■ 4.46
CHTF18-214ENST00000563545 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.84■■■■■ 4.45
CHTF18-214ENST00000563545 CUX2O14529 1486 aa42.75■■■■■ 4.43
CHTF18-214ENST00000563545 NESP48681 1621 aa42.73■■■■■ 4.43
CHTF18-214ENST00000563545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.55■■■■■ 4.4
CHTF18-214ENST00000563545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.45■■■■■ 4.39
CHTF18-214ENST00000563545 WIZO95785 1651 aa42.36■■■■■ 4.37
CHTF18-214ENST00000563545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
CHTF18-214ENST00000563545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.22■■■■■ 4.35
CHTF18-214ENST00000563545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.19■■■■■ 4.34
CHTF18-214ENST00000563545 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.13■■■■■ 4.33
CHTF18-214ENST00000563545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
CHTF18-214ENST00000563545 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.83■■■■■ 4.29
CHTF18-214ENST00000563545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CHTF18-214ENST00000563545 WDR62O43379 1518 aa41.71■■■■■ 4.27
CHTF18-214ENST00000563545 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.69■■■■■ 4.26
CHTF18-214ENST00000563545 CFTRP13569 1480 aa41.67■■■■■ 4.26
CHTF18-214ENST00000563545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.66■■■■■ 4.26
CHTF18-214ENST00000563545 PRDM2Q13029 1718 aa41.35■■■■■ 4.21
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.34■■■■■ 4.21
CHTF18-214ENST00000563545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
CHTF18-214ENST00000563545 TOPBP1Q92547 1522 aa40.89■■■■■ 4.14
CHTF18-214ENST00000563545 IFT140Q96RY7 1462 aa40.85■■■■■ 4.13
CHTF18-214ENST00000563545 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC8Q09428 1581 aa40.8■■■■■ 4.12
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
CHTF18-214ENST00000563545 TRIM41Q8WV44 630 aa40.77■■■■■ 4.12
CHTF18-214ENST00000563545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.77■■■■■ 4.12
CHTF18-214ENST00000563545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
CHTF18-214ENST00000563545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
CHTF18-214ENST00000563545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
CHTF18-214ENST00000563545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.065e-7■■■■□ 19.7
CHTF18-214ENST00000563545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.33■■■■■ 4.05
CHTF18-214ENST00000563545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.31■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 SOGA1O94964 1423 aa40.3■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 CHD1O14646 1710 aa40.28■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CHTF18-214ENST00000563545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.26■■■■■ 4.03
CHTF18-214ENST00000563545 CUX1P39880 1505 aa40.25■■■■■ 4.03
CHTF18-214ENST00000563545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGEF11O15085 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
CHTF18-214ENST00000563545 FBLN2P98095 1184 aa40.14■■■■■ 4.02
CHTF18-214ENST00000563545 WDR97A6NE52 1622 aa40.12■■■■■ 4.01
CHTF18-214ENST00000563545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.02■■■■■ 4
CHTF18-214ENST00000563545 GRIN2BQ13224 1484 aa39.94■■■■□ 3.98
CHTF18-214ENST00000563545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
CHTF18-214ENST00000563545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.86■■■■□ 3.97
CHTF18-214ENST00000563545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
CHTF18-214ENST00000563545 PBRM1Q86U86 1689 aa39.83■■■■□ 3.97
CHTF18-214ENST00000563545 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.81■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.81■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 ARAP1Q96P48 1450 aa39.8■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 SYNJ2O15056 1496 aa39.78■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 SYNJ1O43426 1573 aa39.78■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
CHTF18-214ENST00000563545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.74■■■■□ 3.95
CHTF18-214ENST00000563545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.66■■■■□ 3.94
CHTF18-214ENST00000563545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.66■■■■□ 3.94
CHTF18-214ENST00000563545 TOP2BQ02880 1626 aa39.65■■■■□ 3.94
CHTF18-214ENST00000563545 ADAMTS12P58397 1594 aa39.43■■■■□ 3.9
CHTF18-214ENST00000563545 GRIN2AQ12879 1464 aa39.42■■■■□ 3.9
CHTF18-214ENST00000563545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
CHTF18-214ENST00000563545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.31■■■■□ 3.88
CHTF18-214ENST00000563545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.31■■■■□ 3.88
CHTF18-214ENST00000563545 CEP170Q5SW79 1584 aa39.29■■■■□ 3.88
CHTF18-214ENST00000563545 NUP160Q12769 1436 aa39.28■■■■□ 3.88
CHTF18-214ENST00000563545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.18■■■■□ 3.86
CHTF18-214ENST00000563545 SHROOM2Q13796 1616 aa39.11■■■■□ 3.85
CHTF18-214ENST00000563545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
CHTF18-214ENST00000563545 JPH4Q96JJ6 628 aa38.88■■■■□ 3.81
CHTF18-214ENST00000563545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.87■■■■□ 3.81
CHTF18-214ENST00000563545 KIF27Q86VH2 1401 aa38.85■■■■□ 3.81
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