RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PTPRK-202ENST00000368205 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRK-202ENST00000368205 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-202ENST00000368205 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD1Q16676 465 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRK-202ENST00000368205 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-202ENST00000368205 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-202ENST00000368205 MSH5O43196 834 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRK-202ENST00000368205 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ADRA2BP18089 450 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRK-202ENST00000368205 POTEDQ86YR6 584 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRK-202ENST00000368205 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-202ENST00000368205 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-202ENST00000368205 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRK-202ENST00000368205 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRK-202ENST00000368205 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRK-202ENST00000368205 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRK-202ENST00000368205 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRK-202ENST00000368205 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRK-202ENST00000368205 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRK-202ENST00000368205 RNF39Q9H2S5 420 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRK-202ENST00000368205 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRK-202ENST00000368205 KCNA4P22459 653 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRK-202ENST00000368205 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRK-202ENST00000368205 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.536e-8■□□□□ 10.5
PTPRK-202ENST00000368205 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRK-202ENST00000368205 SLC4A2P04920 1241 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-202ENST00000368205 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRK-202ENST00000368205 CAPN15O75808 1086 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRK-202ENST00000368205 APLP2Q06481 763 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRK-202ENST00000368205 DSG3P32926 999 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRK-202ENST00000368205 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRK-202ENST00000368205 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
PTPRK-202ENST00000368205 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PTPRK-202ENST00000368205 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRK-202ENST00000368205 ABCB7O75027 752 aa17.25■□□□□ 0.35
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB22O15209 634 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRK-202ENST00000368205 POLA2Q14181 598 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRK-202ENST00000368205 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRK-202ENST00000368205 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRK-202ENST00000368205 POTEHQ6S545 545 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-202ENST00000368205 OSCARQ8IYS5 282 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRK-202ENST00000368205 AKT1S1Q96B36 256 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRK-202ENST00000368205 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRK-202ENST00000368205 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-202ENST00000368205 FBLN2P98095 1184 aa16.33■□□□□ 0.2
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PTPRK-202ENST00000368205 SPDYE6P0CI01 402 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-202ENST00000368205 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-202ENST00000368205 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-202ENST00000368205 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRK-202ENST00000368205 PITPNM1O00562 1244 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-202ENST00000368205 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-202ENST00000368205 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-202ENST00000368205 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-202ENST00000368205 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-202ENST00000368205 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
PTPRK-202ENST00000368205 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRK-202ENST00000368205 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-202ENST00000368205 HAX1O00165 279 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-202ENST00000368205 PRR29P0C7W0 189 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRK-202ENST00000368205 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-202ENST00000368205 CHADLQ6NUI6 762 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-202ENST00000368205 EVX2Q03828 476 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-202ENST00000368205 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-202ENST00000368205 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-202ENST00000368205 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-202ENST00000368205 PROM2Q8N271 834 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-202ENST00000368205 CREBZFQ9NS37 354 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-202ENST00000368205 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRK-202ENST00000368205 GABBR2O75899 941 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRK-202ENST00000368205 CLCN6P51797 869 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-202ENST00000368205 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-202ENST00000368205 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-202ENST00000368205 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-202ENST00000368205 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-202ENST00000368205 FKBP8Q14318 412 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-202ENST00000368205 POTEIP0CG38 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHG5O94827 1062 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-202ENST00000368205 MIER1Q8N108 512 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-202ENST00000368205 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-202ENST00000368205 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-202ENST00000368205 PHF12Q96QT6 1004 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-202ENST00000368205 LHX8Q68G74 356 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-202ENST00000368205 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-202ENST00000368205 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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