Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INTS9Q9NV88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS9Q9NV88 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS9Q9NV88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
INTS9Q9NV88 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS9Q9NV88 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
INTS9Q9NV88 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms